Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
JPH4Q96JJ6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
JPH4Q96JJ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
JPH4Q96JJ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
JPH4Q96JJ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC46.19■■■■■ 4.98
JPH4Q96JJ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
JPH4Q96JJ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
JPH4Q96JJ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
JPH4Q96JJ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
JPH4Q96JJ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
JPH4Q96JJ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
JPH4Q96JJ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
JPH4Q96JJ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
JPH4Q96JJ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
JPH4Q96JJ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC46.03■■■■■ 4.96
JPH4Q96JJ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
JPH4Q96JJ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC46■■■■■ 4.95
JPH4Q96JJ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC45.96■■■■■ 4.95
JPH4Q96JJ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
JPH4Q96JJ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC45.94■■■■■ 4.94
JPH4Q96JJ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC45.94■■■■■ 4.94
JPH4Q96JJ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
JPH4Q96JJ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
JPH4Q96JJ6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
JPH4Q96JJ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
JPH4Q96JJ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
JPH4Q96JJ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
JPH4Q96JJ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
JPH4Q96JJ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
JPH4Q96JJ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
JPH4Q96JJ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
JPH4Q96JJ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
JPH4Q96JJ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC45.73■■■■■ 4.91
JPH4Q96JJ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
JPH4Q96JJ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
JPH4Q96JJ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
JPH4Q96JJ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
JPH4Q96JJ6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
JPH4Q96JJ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
JPH4Q96JJ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC45.66■■■■■ 4.9
JPH4Q96JJ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC45.63■■■■■ 4.9
JPH4Q96JJ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
JPH4Q96JJ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.6■■■■■ 4.89
JPH4Q96JJ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
JPH4Q96JJ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC45.59■■■■■ 4.89
JPH4Q96JJ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC45.59■■■■■ 4.89
JPH4Q96JJ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
JPH4Q96JJ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
JPH4Q96JJ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
JPH4Q96JJ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
JPH4Q96JJ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
JPH4Q96JJ6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
JPH4Q96JJ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
JPH4Q96JJ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
JPH4Q96JJ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
JPH4Q96JJ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.87
JPH4Q96JJ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
JPH4Q96JJ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC45.42■■■■■ 4.86
JPH4Q96JJ6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
JPH4Q96JJ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
JPH4Q96JJ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
JPH4Q96JJ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
JPH4Q96JJ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
JPH4Q96JJ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
JPH4Q96JJ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC45.36■■■■■ 4.85
JPH4Q96JJ6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
JPH4Q96JJ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
JPH4Q96JJ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
JPH4Q96JJ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
JPH4Q96JJ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
JPH4Q96JJ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
JPH4Q96JJ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
JPH4Q96JJ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
JPH4Q96JJ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
JPH4Q96JJ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
JPH4Q96JJ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
JPH4Q96JJ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
JPH4Q96JJ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
JPH4Q96JJ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
JPH4Q96JJ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
JPH4Q96JJ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
JPH4Q96JJ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC45.14■■■■■ 4.82
JPH4Q96JJ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
JPH4Q96JJ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
JPH4Q96JJ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
JPH4Q96JJ6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
JPH4Q96JJ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
JPH4Q96JJ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
JPH4Q96JJ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.06■■■■■ 4.8
JPH4Q96JJ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
JPH4Q96JJ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
JPH4Q96JJ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
JPH4Q96JJ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
JPH4Q96JJ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
JPH4Q96JJ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
JPH4Q96JJ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
JPH4Q96JJ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
JPH4Q96JJ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
JPH4Q96JJ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
JPH4Q96JJ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms