Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRIG1Q96JA1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRIG1Q96JA1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRIG1Q96JA1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRIG1Q96JA1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRIG1Q96JA1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRIG1Q96JA1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRIG1Q96JA1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRIG1Q96JA1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRIG1Q96JA1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LRIG1Q96JA1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRIG1Q96JA1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRIG1Q96JA1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRIG1Q96JA1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRIG1Q96JA1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRIG1Q96JA1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRIG1Q96JA1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRIG1Q96JA1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRIG1Q96JA1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LRIG1Q96JA1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRIG1Q96JA1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRIG1Q96JA1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LRIG1Q96JA1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRIG1Q96JA1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRIG1Q96JA1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRIG1Q96JA1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRIG1Q96JA1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRIG1Q96JA1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRIG1Q96JA1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRIG1Q96JA1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRIG1Q96JA1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRIG1Q96JA1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRIG1Q96JA1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRIG1Q96JA1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRIG1Q96JA1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRIG1Q96JA1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRIG1Q96JA1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRIG1Q96JA1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRIG1Q96JA1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRIG1Q96JA1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRIG1Q96JA1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRIG1Q96JA1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRIG1Q96JA1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRIG1Q96JA1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRIG1Q96JA1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRIG1Q96JA1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIG1Q96JA1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIG1Q96JA1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRIG1Q96JA1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRIG1Q96JA1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRIG1Q96JA1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRIG1Q96JA1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRIG1Q96JA1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRIG1Q96JA1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRIG1Q96JA1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRIG1Q96JA1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRIG1Q96JA1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LRIG1Q96JA1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIG1Q96JA1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIG1Q96JA1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIG1Q96JA1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRIG1Q96JA1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRIG1Q96JA1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRIG1Q96JA1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRIG1Q96JA1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRIG1Q96JA1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRIG1Q96JA1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRIG1Q96JA1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRIG1Q96JA1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIG1Q96JA1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIG1Q96JA1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIG1Q96JA1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRIG1Q96JA1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRIG1Q96JA1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRIG1Q96JA1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRIG1Q96JA1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRIG1Q96JA1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRIG1Q96JA1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRIG1Q96JA1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRIG1Q96JA1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRIG1Q96JA1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRIG1Q96JA1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRIG1Q96JA1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRIG1Q96JA1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRIG1Q96JA1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRIG1Q96JA1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms