Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ABCC11Q96J66 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
ABCC11Q96J66 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ABCC11Q96J66 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
ABCC11Q96J66 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
ABCC11Q96J66 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
ABCC11Q96J66 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
ABCC11Q96J66 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
ABCC11Q96J66 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
ABCC11Q96J66 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ABCC11Q96J66 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
ABCC11Q96J66 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
ABCC11Q96J66 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC39.57■■■■□ 3.92
ABCC11Q96J66 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
ABCC11Q96J66 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
ABCC11Q96J66 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
ABCC11Q96J66 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC11Q96J66 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC11Q96J66 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ABCC11Q96J66 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ABCC11Q96J66 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ABCC11Q96J66 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC11Q96J66 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC11Q96J66 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
ABCC11Q96J66 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ABCC11Q96J66 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ABCC11Q96J66 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ABCC11Q96J66 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ABCC11Q96J66 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ABCC11Q96J66 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ABCC11Q96J66 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ABCC11Q96J66 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ABCC11Q96J66 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ABCC11Q96J66 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ABCC11Q96J66 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ABCC11Q96J66 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ABCC11Q96J66 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
ABCC11Q96J66 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ABCC11Q96J66 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ABCC11Q96J66 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ABCC11Q96J66 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ABCC11Q96J66 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ABCC11Q96J66 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ABCC11Q96J66 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ABCC11Q96J66 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ABCC11Q96J66 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
ABCC11Q96J66 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ABCC11Q96J66 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
ABCC11Q96J66 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
ABCC11Q96J66 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ABCC11Q96J66 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ABCC11Q96J66 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC11Q96J66 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
ABCC11Q96J66 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC11Q96J66 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC11Q96J66 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC11Q96J66 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC11Q96J66 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC11Q96J66 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC11Q96J66 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC11Q96J66 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC11Q96J66 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC11Q96J66 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC11Q96J66 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC11Q96J66 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC11Q96J66 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC11Q96J66 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC11Q96J66 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC11Q96J66 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ABCC11Q96J66 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC11Q96J66 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC11Q96J66 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
ABCC11Q96J66 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ABCC11Q96J66 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
ABCC11Q96J66 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
ABCC11Q96J66 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC11Q96J66 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC11Q96J66 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.83
ABCC11Q96J66 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ABCC11Q96J66 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ABCC11Q96J66 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ABCC11Q96J66 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ABCC11Q96J66 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
ABCC11Q96J66 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ABCC11Q96J66 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ABCC11Q96J66 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ABCC11Q96J66 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ABCC11Q96J66 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
ABCC11Q96J66 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
ABCC11Q96J66 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ABCC11Q96J66 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ABCC11Q96J66 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
ABCC11Q96J66 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
ABCC11Q96J66 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ABCC11Q96J66 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ABCC11Q96J66 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ABCC11Q96J66 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ABCC11Q96J66 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ABCC11Q96J66 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
ABCC11Q96J66 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms