Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMD4Q96H15 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMD4Q96H15 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMD4Q96H15 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMD4Q96H15 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMD4Q96H15 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMD4Q96H15 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMD4Q96H15 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMD4Q96H15 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMD4Q96H15 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMD4Q96H15 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMD4Q96H15 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMD4Q96H15 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMD4Q96H15 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMD4Q96H15 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMD4Q96H15 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMD4Q96H15 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMD4Q96H15 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMD4Q96H15 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMD4Q96H15 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMD4Q96H15 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMD4Q96H15 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMD4Q96H15 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMD4Q96H15 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMD4Q96H15 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMD4Q96H15 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMD4Q96H15 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMD4Q96H15 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMD4Q96H15 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMD4Q96H15 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMD4Q96H15 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMD4Q96H15 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMD4Q96H15 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMD4Q96H15 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMD4Q96H15 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMD4Q96H15 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMD4Q96H15 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMD4Q96H15 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMD4Q96H15 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMD4Q96H15 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMD4Q96H15 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMD4Q96H15 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMD4Q96H15 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMD4Q96H15 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMD4Q96H15 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMD4Q96H15 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMD4Q96H15 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMD4Q96H15 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMD4Q96H15 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMD4Q96H15 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMD4Q96H15 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMD4Q96H15 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMD4Q96H15 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMD4Q96H15 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMD4Q96H15 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMD4Q96H15 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMD4Q96H15 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMD4Q96H15 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMD4Q96H15 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMD4Q96H15 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMD4Q96H15 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMD4Q96H15 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMD4Q96H15 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMD4Q96H15 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMD4Q96H15 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMD4Q96H15 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMD4Q96H15 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMD4Q96H15 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMD4Q96H15 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMD4Q96H15 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms