Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BORCS6Q96GS4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BORCS6Q96GS4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BORCS6Q96GS4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BORCS6Q96GS4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BORCS6Q96GS4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BORCS6Q96GS4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BORCS6Q96GS4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BORCS6Q96GS4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BORCS6Q96GS4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BORCS6Q96GS4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BORCS6Q96GS4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BORCS6Q96GS4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BORCS6Q96GS4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BORCS6Q96GS4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BORCS6Q96GS4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BORCS6Q96GS4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BORCS6Q96GS4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BORCS6Q96GS4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BORCS6Q96GS4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BORCS6Q96GS4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BORCS6Q96GS4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BORCS6Q96GS4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BORCS6Q96GS4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BORCS6Q96GS4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BORCS6Q96GS4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BORCS6Q96GS4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BORCS6Q96GS4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BORCS6Q96GS4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BORCS6Q96GS4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BORCS6Q96GS4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BORCS6Q96GS4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BORCS6Q96GS4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BORCS6Q96GS4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BORCS6Q96GS4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BORCS6Q96GS4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BORCS6Q96GS4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BORCS6Q96GS4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BORCS6Q96GS4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BORCS6Q96GS4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BORCS6Q96GS4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BORCS6Q96GS4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BORCS6Q96GS4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BORCS6Q96GS4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BORCS6Q96GS4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BORCS6Q96GS4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BORCS6Q96GS4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BORCS6Q96GS4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BORCS6Q96GS4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BORCS6Q96GS4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BORCS6Q96GS4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BORCS6Q96GS4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BORCS6Q96GS4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
BORCS6Q96GS4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BORCS6Q96GS4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
BORCS6Q96GS4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BORCS6Q96GS4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BORCS6Q96GS4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BORCS6Q96GS4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BORCS6Q96GS4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BORCS6Q96GS4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BORCS6Q96GS4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BORCS6Q96GS4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BORCS6Q96GS4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BORCS6Q96GS4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BORCS6Q96GS4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
BORCS6Q96GS4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BORCS6Q96GS4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BORCS6Q96GS4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BORCS6Q96GS4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BORCS6Q96GS4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BORCS6Q96GS4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BORCS6Q96GS4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BORCS6Q96GS4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms