Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX27Q96GQ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDX27Q96GQ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDX27Q96GQ7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX27Q96GQ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX27Q96GQ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX27Q96GQ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX27Q96GQ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX27Q96GQ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX27Q96GQ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX27Q96GQ7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX27Q96GQ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX27Q96GQ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX27Q96GQ7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX27Q96GQ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX27Q96GQ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX27Q96GQ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX27Q96GQ7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX27Q96GQ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX27Q96GQ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX27Q96GQ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX27Q96GQ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX27Q96GQ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX27Q96GQ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX27Q96GQ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX27Q96GQ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX27Q96GQ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX27Q96GQ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX27Q96GQ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX27Q96GQ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX27Q96GQ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX27Q96GQ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX27Q96GQ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX27Q96GQ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX27Q96GQ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX27Q96GQ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX27Q96GQ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX27Q96GQ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX27Q96GQ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX27Q96GQ7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX27Q96GQ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX27Q96GQ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX27Q96GQ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX27Q96GQ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX27Q96GQ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX27Q96GQ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
DDX27Q96GQ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX27Q96GQ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX27Q96GQ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX27Q96GQ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX27Q96GQ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX27Q96GQ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX27Q96GQ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX27Q96GQ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX27Q96GQ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDX27Q96GQ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX27Q96GQ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX27Q96GQ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX27Q96GQ7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX27Q96GQ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX27Q96GQ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX27Q96GQ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX27Q96GQ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX27Q96GQ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX27Q96GQ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX27Q96GQ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX27Q96GQ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX27Q96GQ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX27Q96GQ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX27Q96GQ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX27Q96GQ7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX27Q96GQ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX27Q96GQ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX27Q96GQ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX27Q96GQ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX27Q96GQ7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX27Q96GQ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX27Q96GQ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX27Q96GQ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX27Q96GQ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX27Q96GQ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX27Q96GQ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX27Q96GQ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX27Q96GQ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX27Q96GQ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
DDX27Q96GQ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX27Q96GQ7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX27Q96GQ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms