Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY4

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16Q96EY4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMA16Q96EY4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMA16Q96EY4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMA16Q96EY4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMA16Q96EY4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMA16Q96EY4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMA16Q96EY4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMA16Q96EY4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMA16Q96EY4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMA16Q96EY4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TMA16Q96EY4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMA16Q96EY4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMA16Q96EY4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMA16Q96EY4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMA16Q96EY4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMA16Q96EY4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMA16Q96EY4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMA16Q96EY4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMA16Q96EY4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMA16Q96EY4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMA16Q96EY4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMA16Q96EY4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMA16Q96EY4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMA16Q96EY4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMA16Q96EY4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMA16Q96EY4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMA16Q96EY4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMA16Q96EY4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMA16Q96EY4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMA16Q96EY4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TMA16Q96EY4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMA16Q96EY4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMA16Q96EY4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMA16Q96EY4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMA16Q96EY4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMA16Q96EY4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMA16Q96EY4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMA16Q96EY4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMA16Q96EY4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMA16Q96EY4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMA16Q96EY4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMA16Q96EY4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMA16Q96EY4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMA16Q96EY4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMA16Q96EY4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMA16Q96EY4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TMA16Q96EY4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TMA16Q96EY4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMA16Q96EY4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMA16Q96EY4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMA16Q96EY4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMA16Q96EY4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMA16Q96EY4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMA16Q96EY4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMA16Q96EY4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMA16Q96EY4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TMA16Q96EY4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMA16Q96EY4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMA16Q96EY4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMA16Q96EY4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMA16Q96EY4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMA16Q96EY4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMA16Q96EY4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMA16Q96EY4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMA16Q96EY4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMA16Q96EY4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMA16Q96EY4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMA16Q96EY4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMA16Q96EY4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMA16Q96EY4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMA16Q96EY4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMA16Q96EY4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMA16Q96EY4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMA16Q96EY4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMA16Q96EY4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMA16Q96EY4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMA16Q96EY4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMA16Q96EY4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMA16Q96EY4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMA16Q96EY4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMA16Q96EY4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMA16Q96EY4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMA16Q96EY4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMA16Q96EY4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMA16Q96EY4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMA16Q96EY4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMA16Q96EY4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMA16Q96EY4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMA16Q96EY4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMA16Q96EY4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMA16Q96EY4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMA16Q96EY4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMA16Q96EY4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMA16Q96EY4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMA16Q96EY4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TMA16Q96EY4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMA16Q96EY4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMA16Q96EY4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMA16Q96EY4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMA16Q96EY4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms