Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ULK4Q96C45 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ULK4Q96C45 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ULK4Q96C45 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ULK4Q96C45 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ULK4Q96C45 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ULK4Q96C45 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ULK4Q96C45 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ULK4Q96C45 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ULK4Q96C45 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ULK4Q96C45 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ULK4Q96C45 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ULK4Q96C45 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ULK4Q96C45 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ULK4Q96C45 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ULK4Q96C45 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ULK4Q96C45 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ULK4Q96C45 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ULK4Q96C45 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ULK4Q96C45 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ULK4Q96C45 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ULK4Q96C45 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ULK4Q96C45 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms