Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FUBP1Q96AE4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FUBP1Q96AE4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FUBP1Q96AE4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FUBP1Q96AE4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FUBP1Q96AE4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FUBP1Q96AE4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FUBP1Q96AE4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FUBP1Q96AE4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FUBP1Q96AE4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FUBP1Q96AE4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FUBP1Q96AE4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FUBP1Q96AE4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FUBP1Q96AE4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FUBP1Q96AE4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FUBP1Q96AE4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FUBP1Q96AE4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FUBP1Q96AE4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FUBP1Q96AE4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FUBP1Q96AE4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FUBP1Q96AE4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FUBP1Q96AE4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FUBP1Q96AE4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FUBP1Q96AE4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FUBP1Q96AE4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FUBP1Q96AE4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FUBP1Q96AE4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FUBP1Q96AE4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FUBP1Q96AE4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FUBP1Q96AE4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FUBP1Q96AE4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FUBP1Q96AE4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FUBP1Q96AE4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FUBP1Q96AE4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FUBP1Q96AE4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FUBP1Q96AE4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FUBP1Q96AE4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FUBP1Q96AE4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FUBP1Q96AE4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FUBP1Q96AE4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FUBP1Q96AE4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FUBP1Q96AE4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FUBP1Q96AE4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FUBP1Q96AE4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FUBP1Q96AE4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FUBP1Q96AE4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FUBP1Q96AE4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FUBP1Q96AE4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FUBP1Q96AE4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FUBP1Q96AE4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FUBP1Q96AE4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FUBP1Q96AE4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FUBP1Q96AE4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FUBP1Q96AE4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FUBP1Q96AE4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FUBP1Q96AE4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FUBP1Q96AE4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FUBP1Q96AE4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FUBP1Q96AE4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FUBP1Q96AE4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FUBP1Q96AE4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FUBP1Q96AE4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FUBP1Q96AE4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FUBP1Q96AE4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FUBP1Q96AE4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FUBP1Q96AE4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FUBP1Q96AE4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FUBP1Q96AE4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FUBP1Q96AE4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FUBP1Q96AE4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FUBP1Q96AE4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FUBP1Q96AE4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FUBP1Q96AE4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FUBP1Q96AE4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FUBP1Q96AE4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FUBP1Q96AE4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FUBP1Q96AE4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FUBP1Q96AE4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FUBP1Q96AE4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FUBP1Q96AE4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FUBP1Q96AE4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FUBP1Q96AE4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FUBP1Q96AE4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FUBP1Q96AE4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FUBP1Q96AE4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FUBP1Q96AE4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms