Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RUBCNQ92622 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUBCNQ92622 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUBCNQ92622 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUBCNQ92622 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUBCNQ92622 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUBCNQ92622 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUBCNQ92622 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUBCNQ92622 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUBCNQ92622 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUBCNQ92622 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUBCNQ92622 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUBCNQ92622 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RUBCNQ92622 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUBCNQ92622 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUBCNQ92622 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUBCNQ92622 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUBCNQ92622 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUBCNQ92622 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RUBCNQ92622 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUBCNQ92622 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RUBCNQ92622 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUBCNQ92622 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUBCNQ92622 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUBCNQ92622 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUBCNQ92622 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUBCNQ92622 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUBCNQ92622 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUBCNQ92622 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUBCNQ92622 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUBCNQ92622 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUBCNQ92622 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUBCNQ92622 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RUBCNQ92622 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUBCNQ92622 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUBCNQ92622 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUBCNQ92622 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUBCNQ92622 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUBCNQ92622 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUBCNQ92622 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RUBCNQ92622 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUBCNQ92622 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUBCNQ92622 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUBCNQ92622 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUBCNQ92622 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUBCNQ92622 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RUBCNQ92622 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RUBCNQ92622 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUBCNQ92622 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUBCNQ92622 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RUBCNQ92622 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUBCNQ92622 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUBCNQ92622 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUBCNQ92622 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUBCNQ92622 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUBCNQ92622 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUBCNQ92622 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUBCNQ92622 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUBCNQ92622 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUBCNQ92622 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUBCNQ92622 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RUBCNQ92622 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RUBCNQ92622 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUBCNQ92622 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUBCNQ92622 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUBCNQ92622 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUBCNQ92622 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUBCNQ92622 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUBCNQ92622 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RUBCNQ92622 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUBCNQ92622 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUBCNQ92622 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUBCNQ92622 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUBCNQ92622 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUBCNQ92622 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUBCNQ92622 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUBCNQ92622 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUBCNQ92622 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUBCNQ92622 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUBCNQ92622 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RUBCNQ92622 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUBCNQ92622 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUBCNQ92622 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUBCNQ92622 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUBCNQ92622 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms