Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MDM1Q8TC05 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MDM1Q8TC05 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MDM1Q8TC05 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MDM1Q8TC05 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MDM1Q8TC05 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MDM1Q8TC05 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MDM1Q8TC05 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MDM1Q8TC05 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MDM1Q8TC05 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MDM1Q8TC05 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MDM1Q8TC05 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MDM1Q8TC05 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MDM1Q8TC05 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MDM1Q8TC05 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MDM1Q8TC05 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MDM1Q8TC05 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MDM1Q8TC05 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MDM1Q8TC05 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MDM1Q8TC05 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MDM1Q8TC05 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MDM1Q8TC05 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MDM1Q8TC05 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MDM1Q8TC05 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MDM1Q8TC05 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MDM1Q8TC05 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MDM1Q8TC05 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MDM1Q8TC05 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MDM1Q8TC05 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MDM1Q8TC05 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MDM1Q8TC05 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MDM1Q8TC05 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MDM1Q8TC05 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MDM1Q8TC05 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MDM1Q8TC05 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MDM1Q8TC05 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MDM1Q8TC05 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MDM1Q8TC05 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MDM1Q8TC05 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MDM1Q8TC05 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MDM1Q8TC05 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MDM1Q8TC05 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MDM1Q8TC05 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MDM1Q8TC05 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MDM1Q8TC05 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MDM1Q8TC05 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MDM1Q8TC05 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MDM1Q8TC05 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MDM1Q8TC05 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MDM1Q8TC05 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MDM1Q8TC05 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MDM1Q8TC05 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MDM1Q8TC05 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MDM1Q8TC05 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MDM1Q8TC05 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MDM1Q8TC05 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms