Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDPRQ8NCN5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDPRQ8NCN5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PDPRQ8NCN5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDPRQ8NCN5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDPRQ8NCN5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDPRQ8NCN5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDPRQ8NCN5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDPRQ8NCN5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDPRQ8NCN5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDPRQ8NCN5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDPRQ8NCN5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDPRQ8NCN5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDPRQ8NCN5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDPRQ8NCN5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDPRQ8NCN5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDPRQ8NCN5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDPRQ8NCN5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDPRQ8NCN5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDPRQ8NCN5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDPRQ8NCN5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDPRQ8NCN5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDPRQ8NCN5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PDPRQ8NCN5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDPRQ8NCN5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDPRQ8NCN5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDPRQ8NCN5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDPRQ8NCN5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDPRQ8NCN5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDPRQ8NCN5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDPRQ8NCN5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDPRQ8NCN5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDPRQ8NCN5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDPRQ8NCN5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDPRQ8NCN5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDPRQ8NCN5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDPRQ8NCN5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDPRQ8NCN5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDPRQ8NCN5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDPRQ8NCN5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDPRQ8NCN5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDPRQ8NCN5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDPRQ8NCN5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDPRQ8NCN5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDPRQ8NCN5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDPRQ8NCN5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDPRQ8NCN5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDPRQ8NCN5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDPRQ8NCN5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDPRQ8NCN5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDPRQ8NCN5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDPRQ8NCN5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDPRQ8NCN5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDPRQ8NCN5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDPRQ8NCN5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDPRQ8NCN5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDPRQ8NCN5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDPRQ8NCN5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDPRQ8NCN5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDPRQ8NCN5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDPRQ8NCN5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDPRQ8NCN5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDPRQ8NCN5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDPRQ8NCN5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDPRQ8NCN5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDPRQ8NCN5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDPRQ8NCN5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDPRQ8NCN5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDPRQ8NCN5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDPRQ8NCN5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDPRQ8NCN5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDPRQ8NCN5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDPRQ8NCN5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDPRQ8NCN5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDPRQ8NCN5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDPRQ8NCN5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDPRQ8NCN5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDPRQ8NCN5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDPRQ8NCN5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDPRQ8NCN5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDPRQ8NCN5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDPRQ8NCN5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDPRQ8NCN5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDPRQ8NCN5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDPRQ8NCN5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDPRQ8NCN5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDPRQ8NCN5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDPRQ8NCN5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms