Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MFSD2AQ8NA29 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MFSD2AQ8NA29 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MFSD2AQ8NA29 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MFSD2AQ8NA29 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MFSD2AQ8NA29 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MFSD2AQ8NA29 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MFSD2AQ8NA29 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFSD2AQ8NA29 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MFSD2AQ8NA29 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFSD2AQ8NA29 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MFSD2AQ8NA29 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MFSD2AQ8NA29 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MFSD2AQ8NA29 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MFSD2AQ8NA29 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MFSD2AQ8NA29 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MFSD2AQ8NA29 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFSD2AQ8NA29 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFSD2AQ8NA29 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFSD2AQ8NA29 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFSD2AQ8NA29 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MFSD2AQ8NA29 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MFSD2AQ8NA29 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MFSD2AQ8NA29 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MFSD2AQ8NA29 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MFSD2AQ8NA29 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MFSD2AQ8NA29 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MFSD2AQ8NA29 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MFSD2AQ8NA29 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MFSD2AQ8NA29 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MFSD2AQ8NA29 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MFSD2AQ8NA29 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MFSD2AQ8NA29 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFSD2AQ8NA29 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFSD2AQ8NA29 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MFSD2AQ8NA29 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFSD2AQ8NA29 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFSD2AQ8NA29 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFSD2AQ8NA29 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFSD2AQ8NA29 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MFSD2AQ8NA29 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFSD2AQ8NA29 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFSD2AQ8NA29 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFSD2AQ8NA29 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MFSD2AQ8NA29 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MFSD2AQ8NA29 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MFSD2AQ8NA29 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MFSD2AQ8NA29 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MFSD2AQ8NA29 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MFSD2AQ8NA29 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MFSD2AQ8NA29 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
MFSD2AQ8NA29 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MFSD2AQ8NA29 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MFSD2AQ8NA29 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MFSD2AQ8NA29 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MFSD2AQ8NA29 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MFSD2AQ8NA29 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MFSD2AQ8NA29 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MFSD2AQ8NA29 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MFSD2AQ8NA29 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MFSD2AQ8NA29 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MFSD2AQ8NA29 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MFSD2AQ8NA29 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MFSD2AQ8NA29 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MFSD2AQ8NA29 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MFSD2AQ8NA29 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MFSD2AQ8NA29 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MFSD2AQ8NA29 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MFSD2AQ8NA29 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MFSD2AQ8NA29 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms