Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWJ2

GCC2, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC2Q8IWJ2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
GCC2Q8IWJ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
GCC2Q8IWJ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
GCC2Q8IWJ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
GCC2Q8IWJ2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
GCC2Q8IWJ2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
GCC2Q8IWJ2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
GCC2Q8IWJ2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
GCC2Q8IWJ2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
GCC2Q8IWJ2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
GCC2Q8IWJ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
GCC2Q8IWJ2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
GCC2Q8IWJ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
GCC2Q8IWJ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
GCC2Q8IWJ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
GCC2Q8IWJ2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
GCC2Q8IWJ2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
GCC2Q8IWJ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
GCC2Q8IWJ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
GCC2Q8IWJ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
GCC2Q8IWJ2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
GCC2Q8IWJ2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
GCC2Q8IWJ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
GCC2Q8IWJ2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
GCC2Q8IWJ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
GCC2Q8IWJ2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
GCC2Q8IWJ2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
GCC2Q8IWJ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
GCC2Q8IWJ2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
GCC2Q8IWJ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
GCC2Q8IWJ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
GCC2Q8IWJ2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
GCC2Q8IWJ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
GCC2Q8IWJ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
GCC2Q8IWJ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
GCC2Q8IWJ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.4■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
GCC2Q8IWJ2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
GCC2Q8IWJ2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
GCC2Q8IWJ2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
GCC2Q8IWJ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
GCC2Q8IWJ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
GCC2Q8IWJ2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
GCC2Q8IWJ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
GCC2Q8IWJ2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
GCC2Q8IWJ2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
GCC2Q8IWJ2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
GCC2Q8IWJ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
GCC2Q8IWJ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
GCC2Q8IWJ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
GCC2Q8IWJ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
GCC2Q8IWJ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
GCC2Q8IWJ2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
GCC2Q8IWJ2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
GCC2Q8IWJ2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
GCC2Q8IWJ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
GCC2Q8IWJ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
GCC2Q8IWJ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
GCC2Q8IWJ2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
GCC2Q8IWJ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
GCC2Q8IWJ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
GCC2Q8IWJ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
GCC2Q8IWJ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
GCC2Q8IWJ2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
GCC2Q8IWJ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.17
GCC2Q8IWJ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
GCC2Q8IWJ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
GCC2Q8IWJ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
GCC2Q8IWJ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
GCC2Q8IWJ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
GCC2Q8IWJ2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
GCC2Q8IWJ2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
GCC2Q8IWJ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GCC2Q8IWJ2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
GCC2Q8IWJ2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
GCC2Q8IWJ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
GCC2Q8IWJ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
GCC2Q8IWJ2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
GCC2Q8IWJ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
GCC2Q8IWJ2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
GCC2Q8IWJ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
GCC2Q8IWJ2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
GCC2Q8IWJ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
GCC2Q8IWJ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
GCC2Q8IWJ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
GCC2Q8IWJ2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
GCC2Q8IWJ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
GCC2Q8IWJ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
GCC2Q8IWJ2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms