Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG4Q86SJ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSG4Q86SJ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSG4Q86SJ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG4Q86SJ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG4Q86SJ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG4Q86SJ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSG4Q86SJ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSG4Q86SJ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSG4Q86SJ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSG4Q86SJ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSG4Q86SJ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG4Q86SJ6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG4Q86SJ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG4Q86SJ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG4Q86SJ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG4Q86SJ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG4Q86SJ6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG4Q86SJ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSG4Q86SJ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSG4Q86SJ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSG4Q86SJ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DSG4Q86SJ6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSG4Q86SJ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSG4Q86SJ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
DSG4Q86SJ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG4Q86SJ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DSG4Q86SJ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSG4Q86SJ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSG4Q86SJ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DSG4Q86SJ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSG4Q86SJ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSG4Q86SJ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSG4Q86SJ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSG4Q86SJ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DSG4Q86SJ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DSG4Q86SJ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DSG4Q86SJ6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DSG4Q86SJ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DSG4Q86SJ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DSG4Q86SJ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DSG4Q86SJ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DSG4Q86SJ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DSG4Q86SJ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSG4Q86SJ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSG4Q86SJ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSG4Q86SJ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSG4Q86SJ6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DSG4Q86SJ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DSG4Q86SJ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DSG4Q86SJ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DSG4Q86SJ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSG4Q86SJ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSG4Q86SJ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSG4Q86SJ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG4Q86SJ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DSG4Q86SJ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DSG4Q86SJ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DSG4Q86SJ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DSG4Q86SJ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSG4Q86SJ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DSG4Q86SJ6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DSG4Q86SJ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG4Q86SJ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG4Q86SJ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSG4Q86SJ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSG4Q86SJ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DSG4Q86SJ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG4Q86SJ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG4Q86SJ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DSG4Q86SJ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DSG4Q86SJ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DSG4Q86SJ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DSG4Q86SJ6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DSG4Q86SJ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG4Q86SJ6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DSG4Q86SJ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DSG4Q86SJ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DSG4Q86SJ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DSG4Q86SJ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DSG4Q86SJ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG4Q86SJ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG4Q86SJ6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DSG4Q86SJ6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DSG4Q86SJ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DSG4Q86SJ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DSG4Q86SJ6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DSG4Q86SJ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DSG4Q86SJ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DSG4Q86SJ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DSG4Q86SJ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DSG4Q86SJ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DSG4Q86SJ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DSG4Q86SJ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DSG4Q86SJ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DSG4Q86SJ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DSG4Q86SJ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DSG4Q86SJ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DSG4Q86SJ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DSG4Q86SJ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms