Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PPP1R42Q7Z4L9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPP1R42Q7Z4L9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPP1R42Q7Z4L9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPP1R42Q7Z4L9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPP1R42Q7Z4L9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPP1R42Q7Z4L9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PPP1R42Q7Z4L9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPP1R42Q7Z4L9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPP1R42Q7Z4L9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPP1R42Q7Z4L9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PPP1R42Q7Z4L9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPP1R42Q7Z4L9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
PPP1R42Q7Z4L9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPP1R42Q7Z4L9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PPP1R42Q7Z4L9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PPP1R42Q7Z4L9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PPP1R42Q7Z4L9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PPP1R42Q7Z4L9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPP1R42Q7Z4L9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PPP1R42Q7Z4L9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PPP1R42Q7Z4L9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PPP1R42Q7Z4L9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PPP1R42Q7Z4L9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PPP1R42Q7Z4L9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PPP1R42Q7Z4L9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PPP1R42Q7Z4L9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PPP1R42Q7Z4L9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PPP1R42Q7Z4L9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPP1R42Q7Z4L9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PPP1R42Q7Z4L9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PPP1R42Q7Z4L9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PPP1R42Q7Z4L9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPP1R42Q7Z4L9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PPP1R42Q7Z4L9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PPP1R42Q7Z4L9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPP1R42Q7Z4L9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPP1R42Q7Z4L9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PPP1R42Q7Z4L9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPP1R42Q7Z4L9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPP1R42Q7Z4L9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PPP1R42Q7Z4L9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PPP1R42Q7Z4L9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPP1R42Q7Z4L9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PPP1R42Q7Z4L9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPP1R42Q7Z4L9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PPP1R42Q7Z4L9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PPP1R42Q7Z4L9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PPP1R42Q7Z4L9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PPP1R42Q7Z4L9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PPP1R42Q7Z4L9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PPP1R42Q7Z4L9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PPP1R42Q7Z4L9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PPP1R42Q7Z4L9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PPP1R42Q7Z4L9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PPP1R42Q7Z4L9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PPP1R42Q7Z4L9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PPP1R42Q7Z4L9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PPP1R42Q7Z4L9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35■■■■□ 3.19
PPP1R42Q7Z4L9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PPP1R42Q7Z4L9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PPP1R42Q7Z4L9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PPP1R42Q7Z4L9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PPP1R42Q7Z4L9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PPP1R42Q7Z4L9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PPP1R42Q7Z4L9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PPP1R42Q7Z4L9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PPP1R42Q7Z4L9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PPP1R42Q7Z4L9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PPP1R42Q7Z4L9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PPP1R42Q7Z4L9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PPP1R42Q7Z4L9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PPP1R42Q7Z4L9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PPP1R42Q7Z4L9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PPP1R42Q7Z4L9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PPP1R42Q7Z4L9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PPP1R42Q7Z4L9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PPP1R42Q7Z4L9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PPP1R42Q7Z4L9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PPP1R42Q7Z4L9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PPP1R42Q7Z4L9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PPP1R42Q7Z4L9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PPP1R42Q7Z4L9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PPP1R42Q7Z4L9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPP1R42Q7Z4L9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPP1R42Q7Z4L9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPP1R42Q7Z4L9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms