Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTF1AQ7RTS3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PTF1AQ7RTS3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTF1AQ7RTS3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTF1AQ7RTS3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTF1AQ7RTS3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
PTF1AQ7RTS3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PTF1AQ7RTS3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTF1AQ7RTS3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTF1AQ7RTS3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTF1AQ7RTS3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTF1AQ7RTS3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTF1AQ7RTS3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTF1AQ7RTS3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTF1AQ7RTS3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTF1AQ7RTS3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTF1AQ7RTS3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTF1AQ7RTS3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
PTF1AQ7RTS3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTF1AQ7RTS3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTF1AQ7RTS3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTF1AQ7RTS3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PTF1AQ7RTS3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PTF1AQ7RTS3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTF1AQ7RTS3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PTF1AQ7RTS3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTF1AQ7RTS3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTF1AQ7RTS3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTF1AQ7RTS3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTF1AQ7RTS3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTF1AQ7RTS3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTF1AQ7RTS3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTF1AQ7RTS3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTF1AQ7RTS3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTF1AQ7RTS3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTF1AQ7RTS3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PTF1AQ7RTS3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTF1AQ7RTS3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTF1AQ7RTS3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTF1AQ7RTS3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTF1AQ7RTS3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTF1AQ7RTS3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTF1AQ7RTS3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTF1AQ7RTS3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTF1AQ7RTS3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PTF1AQ7RTS3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTF1AQ7RTS3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTF1AQ7RTS3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTF1AQ7RTS3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PTF1AQ7RTS3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTF1AQ7RTS3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTF1AQ7RTS3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTF1AQ7RTS3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTF1AQ7RTS3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTF1AQ7RTS3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTF1AQ7RTS3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PTF1AQ7RTS3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
PTF1AQ7RTS3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTF1AQ7RTS3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTF1AQ7RTS3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTF1AQ7RTS3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTF1AQ7RTS3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTF1AQ7RTS3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTF1AQ7RTS3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTF1AQ7RTS3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTF1AQ7RTS3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTF1AQ7RTS3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTF1AQ7RTS3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTF1AQ7RTS3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTF1AQ7RTS3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTF1AQ7RTS3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTF1AQ7RTS3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTF1AQ7RTS3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTF1AQ7RTS3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTF1AQ7RTS3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTF1AQ7RTS3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTF1AQ7RTS3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTF1AQ7RTS3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTF1AQ7RTS3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTF1AQ7RTS3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTF1AQ7RTS3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTF1AQ7RTS3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTF1AQ7RTS3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTF1AQ7RTS3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTF1AQ7RTS3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTF1AQ7RTS3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTF1AQ7RTS3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTF1AQ7RTS3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTF1AQ7RTS3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTF1AQ7RTS3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTF1AQ7RTS3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTF1AQ7RTS3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTF1AQ7RTS3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTF1AQ7RTS3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTF1AQ7RTS3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTF1AQ7RTS3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTF1AQ7RTS3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTF1AQ7RTS3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms