Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
HECW1Q76N89 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
HECW1Q76N89 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
HECW1Q76N89 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
HECW1Q76N89 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.69
HECW1Q76N89 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
HECW1Q76N89 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
HECW1Q76N89 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
HECW1Q76N89 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
HECW1Q76N89 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
HECW1Q76N89 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.67
HECW1Q76N89 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
HECW1Q76N89 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
HECW1Q76N89 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
HECW1Q76N89 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
HECW1Q76N89 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
HECW1Q76N89 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
HECW1Q76N89 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
HECW1Q76N89 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
HECW1Q76N89 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
HECW1Q76N89 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
HECW1Q76N89 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
HECW1Q76N89 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
HECW1Q76N89 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
HECW1Q76N89 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
HECW1Q76N89 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
HECW1Q76N89 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
HECW1Q76N89 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
HECW1Q76N89 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
HECW1Q76N89 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
HECW1Q76N89 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
HECW1Q76N89 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
HECW1Q76N89 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
HECW1Q76N89 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
HECW1Q76N89 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
HECW1Q76N89 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
HECW1Q76N89 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC43.87■■■■■ 4.61
HECW1Q76N89 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
HECW1Q76N89 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.84■■■■■ 4.61
HECW1Q76N89 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.81■■■■■ 4.6
HECW1Q76N89 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
HECW1Q76N89 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
HECW1Q76N89 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
HECW1Q76N89 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
HECW1Q76N89 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
HECW1Q76N89 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
HECW1Q76N89 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
HECW1Q76N89 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
HECW1Q76N89 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
HECW1Q76N89 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
HECW1Q76N89 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
HECW1Q76N89 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
HECW1Q76N89 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
HECW1Q76N89 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
HECW1Q76N89 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
HECW1Q76N89 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
HECW1Q76N89 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
HECW1Q76N89 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
HECW1Q76N89 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
HECW1Q76N89 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
HECW1Q76N89 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
HECW1Q76N89 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
HECW1Q76N89 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
HECW1Q76N89 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
HECW1Q76N89 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
HECW1Q76N89 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
HECW1Q76N89 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
HECW1Q76N89 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
HECW1Q76N89 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
HECW1Q76N89 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
HECW1Q76N89 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
HECW1Q76N89 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
HECW1Q76N89 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
HECW1Q76N89 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
HECW1Q76N89 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
HECW1Q76N89 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
HECW1Q76N89 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
HECW1Q76N89 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
HECW1Q76N89 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
HECW1Q76N89 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
HECW1Q76N89 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
HECW1Q76N89 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
HECW1Q76N89 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
HECW1Q76N89 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
HECW1Q76N89 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
HECW1Q76N89 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
HECW1Q76N89 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
HECW1Q76N89 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
HECW1Q76N89 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
HECW1Q76N89 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
HECW1Q76N89 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
HECW1Q76N89 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
HECW1Q76N89 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
HECW1Q76N89 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
HECW1Q76N89 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
HECW1Q76N89 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
HECW1Q76N89 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
HECW1Q76N89 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
HECW1Q76N89 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
HECW1Q76N89 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms