Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL4BQ6ZWI9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL4BQ6ZWI9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL4BQ6ZWI9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL4BQ6ZWI9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL4BQ6ZWI9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL4BQ6ZWI9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL4BQ6ZWI9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL4BQ6ZWI9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL4BQ6ZWI9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL4BQ6ZWI9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL4BQ6ZWI9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFPL4BQ6ZWI9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL4BQ6ZWI9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFPL4BQ6ZWI9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFPL4BQ6ZWI9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFPL4BQ6ZWI9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFPL4BQ6ZWI9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFPL4BQ6ZWI9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFPL4BQ6ZWI9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFPL4BQ6ZWI9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFPL4BQ6ZWI9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFPL4BQ6ZWI9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFPL4BQ6ZWI9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFPL4BQ6ZWI9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFPL4BQ6ZWI9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFPL4BQ6ZWI9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFPL4BQ6ZWI9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFPL4BQ6ZWI9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL4BQ6ZWI9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL4BQ6ZWI9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL4BQ6ZWI9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFPL4BQ6ZWI9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFPL4BQ6ZWI9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFPL4BQ6ZWI9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFPL4BQ6ZWI9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFPL4BQ6ZWI9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL4BQ6ZWI9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL4BQ6ZWI9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL4BQ6ZWI9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL4BQ6ZWI9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFPL4BQ6ZWI9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL4BQ6ZWI9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL4BQ6ZWI9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms