Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GBP6Q6ZN66 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GBP6Q6ZN66 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GBP6Q6ZN66 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GBP6Q6ZN66 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GBP6Q6ZN66 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GBP6Q6ZN66 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GBP6Q6ZN66 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GBP6Q6ZN66 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GBP6Q6ZN66 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GBP6Q6ZN66 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GBP6Q6ZN66 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GBP6Q6ZN66 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GBP6Q6ZN66 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GBP6Q6ZN66 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GBP6Q6ZN66 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GBP6Q6ZN66 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GBP6Q6ZN66 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GBP6Q6ZN66 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GBP6Q6ZN66 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GBP6Q6ZN66 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GBP6Q6ZN66 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms