Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GBP6Q6ZN66 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GBP6Q6ZN66 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GBP6Q6ZN66 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GBP6Q6ZN66 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GBP6Q6ZN66 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GBP6Q6ZN66 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP6Q6ZN66 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GBP6Q6ZN66 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP6Q6ZN66 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GBP6Q6ZN66 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GBP6Q6ZN66 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GBP6Q6ZN66 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GBP6Q6ZN66 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GBP6Q6ZN66 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GBP6Q6ZN66 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GBP6Q6ZN66 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GBP6Q6ZN66 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GBP6Q6ZN66 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GBP6Q6ZN66 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GBP6Q6ZN66 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GBP6Q6ZN66 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP6Q6ZN66 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GBP6Q6ZN66 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GBP6Q6ZN66 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GBP6Q6ZN66 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GBP6Q6ZN66 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GBP6Q6ZN66 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP6Q6ZN66 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms