Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEACAM20Q6UY09 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEACAM20Q6UY09 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEACAM20Q6UY09 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEACAM20Q6UY09 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEACAM20Q6UY09 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEACAM20Q6UY09 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEACAM20Q6UY09 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEACAM20Q6UY09 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEACAM20Q6UY09 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEACAM20Q6UY09 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEACAM20Q6UY09 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CEACAM20Q6UY09 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEACAM20Q6UY09 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEACAM20Q6UY09 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEACAM20Q6UY09 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEACAM20Q6UY09 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEACAM20Q6UY09 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEACAM20Q6UY09 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEACAM20Q6UY09 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEACAM20Q6UY09 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEACAM20Q6UY09 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEACAM20Q6UY09 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEACAM20Q6UY09 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CEACAM20Q6UY09 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEACAM20Q6UY09 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEACAM20Q6UY09 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEACAM20Q6UY09 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEACAM20Q6UY09 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEACAM20Q6UY09 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEACAM20Q6UY09 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEACAM20Q6UY09 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEACAM20Q6UY09 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEACAM20Q6UY09 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEACAM20Q6UY09 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEACAM20Q6UY09 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEACAM20Q6UY09 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEACAM20Q6UY09 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEACAM20Q6UY09 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEACAM20Q6UY09 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CEACAM20Q6UY09 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM20Q6UY09 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM20Q6UY09 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM20Q6UY09 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM20Q6UY09 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM20Q6UY09 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM20Q6UY09 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEACAM20Q6UY09 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEACAM20Q6UY09 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEACAM20Q6UY09 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEACAM20Q6UY09 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEACAM20Q6UY09 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CEACAM20Q6UY09 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEACAM20Q6UY09 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEACAM20Q6UY09 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEACAM20Q6UY09 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEACAM20Q6UY09 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEACAM20Q6UY09 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEACAM20Q6UY09 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEACAM20Q6UY09 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEACAM20Q6UY09 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEACAM20Q6UY09 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEACAM20Q6UY09 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEACAM20Q6UY09 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEACAM20Q6UY09 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEACAM20Q6UY09 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEACAM20Q6UY09 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEACAM20Q6UY09 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEACAM20Q6UY09 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CEACAM20Q6UY09 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEACAM20Q6UY09 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEACAM20Q6UY09 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEACAM20Q6UY09 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEACAM20Q6UY09 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEACAM20Q6UY09 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEACAM20Q6UY09 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEACAM20Q6UY09 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEACAM20Q6UY09 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEACAM20Q6UY09 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEACAM20Q6UY09 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEACAM20Q6UY09 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEACAM20Q6UY09 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms