Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL35Q6PF15 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL35Q6PF15 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL35Q6PF15 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL35Q6PF15 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL35Q6PF15 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL35Q6PF15 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL35Q6PF15 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KLHL35Q6PF15 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KLHL35Q6PF15 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL35Q6PF15 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL35Q6PF15 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL35Q6PF15 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL35Q6PF15 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL35Q6PF15 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL35Q6PF15 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL35Q6PF15 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL35Q6PF15 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL35Q6PF15 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL35Q6PF15 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL35Q6PF15 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL35Q6PF15 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL35Q6PF15 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL35Q6PF15 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL35Q6PF15 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL35Q6PF15 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL35Q6PF15 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL35Q6PF15 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL35Q6PF15 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL35Q6PF15 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL35Q6PF15 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL35Q6PF15 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL35Q6PF15 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL35Q6PF15 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL35Q6PF15 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL35Q6PF15 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL35Q6PF15 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL35Q6PF15 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL35Q6PF15 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KLHL35Q6PF15 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL35Q6PF15 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL35Q6PF15 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL35Q6PF15 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL35Q6PF15 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL35Q6PF15 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL35Q6PF15 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL35Q6PF15 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL35Q6PF15 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL35Q6PF15 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KLHL35Q6PF15 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL35Q6PF15 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL35Q6PF15 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL35Q6PF15 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL35Q6PF15 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL35Q6PF15 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL35Q6PF15 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL35Q6PF15 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL35Q6PF15 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL35Q6PF15 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL35Q6PF15 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL35Q6PF15 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL35Q6PF15 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL35Q6PF15 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL35Q6PF15 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL35Q6PF15 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL35Q6PF15 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL35Q6PF15 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL35Q6PF15 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL35Q6PF15 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL35Q6PF15 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL35Q6PF15 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL35Q6PF15 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL35Q6PF15 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL35Q6PF15 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL35Q6PF15 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL35Q6PF15 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL35Q6PF15 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHL35Q6PF15 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL35Q6PF15 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL35Q6PF15 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL35Q6PF15 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL35Q6PF15 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL35Q6PF15 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL35Q6PF15 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL35Q6PF15 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL35Q6PF15 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL35Q6PF15 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL35Q6PF15 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL35Q6PF15 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms