Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
LMOD2Q6P5Q4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
LMOD2Q6P5Q4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
LMOD2Q6P5Q4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
LMOD2Q6P5Q4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
LMOD2Q6P5Q4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
LMOD2Q6P5Q4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
LMOD2Q6P5Q4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
LMOD2Q6P5Q4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
LMOD2Q6P5Q4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
LMOD2Q6P5Q4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
LMOD2Q6P5Q4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
LMOD2Q6P5Q4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
LMOD2Q6P5Q4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
LMOD2Q6P5Q4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
LMOD2Q6P5Q4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
LMOD2Q6P5Q4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
LMOD2Q6P5Q4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
LMOD2Q6P5Q4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LMOD2Q6P5Q4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
LMOD2Q6P5Q4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
LMOD2Q6P5Q4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
LMOD2Q6P5Q4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
LMOD2Q6P5Q4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
LMOD2Q6P5Q4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
LMOD2Q6P5Q4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
LMOD2Q6P5Q4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
LMOD2Q6P5Q4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
LMOD2Q6P5Q4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
LMOD2Q6P5Q4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
LMOD2Q6P5Q4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
LMOD2Q6P5Q4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
LMOD2Q6P5Q4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
LMOD2Q6P5Q4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
LMOD2Q6P5Q4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
LMOD2Q6P5Q4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
LMOD2Q6P5Q4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
LMOD2Q6P5Q4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
LMOD2Q6P5Q4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LMOD2Q6P5Q4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
LMOD2Q6P5Q4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LMOD2Q6P5Q4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
LMOD2Q6P5Q4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
LMOD2Q6P5Q4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
LMOD2Q6P5Q4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
LMOD2Q6P5Q4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
LMOD2Q6P5Q4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
LMOD2Q6P5Q4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
LMOD2Q6P5Q4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
LMOD2Q6P5Q4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
LMOD2Q6P5Q4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
LMOD2Q6P5Q4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
LMOD2Q6P5Q4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
LMOD2Q6P5Q4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
LMOD2Q6P5Q4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LMOD2Q6P5Q4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LMOD2Q6P5Q4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
LMOD2Q6P5Q4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
LMOD2Q6P5Q4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
LMOD2Q6P5Q4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
LMOD2Q6P5Q4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
LMOD2Q6P5Q4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
LMOD2Q6P5Q4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
LMOD2Q6P5Q4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
LMOD2Q6P5Q4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
LMOD2Q6P5Q4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
LMOD2Q6P5Q4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
LMOD2Q6P5Q4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
LMOD2Q6P5Q4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LMOD2Q6P5Q4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
LMOD2Q6P5Q4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
LMOD2Q6P5Q4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LMOD2Q6P5Q4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LMOD2Q6P5Q4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LMOD2Q6P5Q4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LMOD2Q6P5Q4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
LMOD2Q6P5Q4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
LMOD2Q6P5Q4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
LMOD2Q6P5Q4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
LMOD2Q6P5Q4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
LMOD2Q6P5Q4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LMOD2Q6P5Q4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LMOD2Q6P5Q4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LMOD2Q6P5Q4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LMOD2Q6P5Q4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LMOD2Q6P5Q4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LMOD2Q6P5Q4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LMOD2Q6P5Q4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
LMOD2Q6P5Q4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
LMOD2Q6P5Q4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LMOD2Q6P5Q4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LMOD2Q6P5Q4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
LMOD2Q6P5Q4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
LMOD2Q6P5Q4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
LMOD2Q6P5Q4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
LMOD2Q6P5Q4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LMOD2Q6P5Q4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms