Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM68Q6AZZ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM68Q6AZZ1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM68Q6AZZ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM68Q6AZZ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM68Q6AZZ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM68Q6AZZ1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM68Q6AZZ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM68Q6AZZ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM68Q6AZZ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM68Q6AZZ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM68Q6AZZ1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM68Q6AZZ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM68Q6AZZ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM68Q6AZZ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM68Q6AZZ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM68Q6AZZ1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM68Q6AZZ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM68Q6AZZ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM68Q6AZZ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM68Q6AZZ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM68Q6AZZ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM68Q6AZZ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM68Q6AZZ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM68Q6AZZ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM68Q6AZZ1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM68Q6AZZ1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM68Q6AZZ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM68Q6AZZ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM68Q6AZZ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM68Q6AZZ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM68Q6AZZ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM68Q6AZZ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM68Q6AZZ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM68Q6AZZ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM68Q6AZZ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM68Q6AZZ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM68Q6AZZ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM68Q6AZZ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM68Q6AZZ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM68Q6AZZ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM68Q6AZZ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM68Q6AZZ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM68Q6AZZ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM68Q6AZZ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM68Q6AZZ1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM68Q6AZZ1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM68Q6AZZ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM68Q6AZZ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM68Q6AZZ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM68Q6AZZ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM68Q6AZZ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM68Q6AZZ1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM68Q6AZZ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM68Q6AZZ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM68Q6AZZ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM68Q6AZZ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM68Q6AZZ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM68Q6AZZ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM68Q6AZZ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM68Q6AZZ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM68Q6AZZ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM68Q6AZZ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM68Q6AZZ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM68Q6AZZ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM68Q6AZZ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM68Q6AZZ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM68Q6AZZ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM68Q6AZZ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM68Q6AZZ1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM68Q6AZZ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM68Q6AZZ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM68Q6AZZ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM68Q6AZZ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM68Q6AZZ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM68Q6AZZ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM68Q6AZZ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIM68Q6AZZ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIM68Q6AZZ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM68Q6AZZ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM68Q6AZZ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM68Q6AZZ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM68Q6AZZ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM68Q6AZZ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM68Q6AZZ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM68Q6AZZ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM68Q6AZZ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM68Q6AZZ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms