Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9BQ674R7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9BQ674R7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9BQ674R7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9BQ674R7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9BQ674R7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATG9BQ674R7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG9BQ674R7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9BQ674R7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9BQ674R7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9BQ674R7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9BQ674R7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG9BQ674R7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG9BQ674R7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9BQ674R7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9BQ674R7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9BQ674R7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9BQ674R7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9BQ674R7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG9BQ674R7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG9BQ674R7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATG9BQ674R7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG9BQ674R7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG9BQ674R7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG9BQ674R7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG9BQ674R7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG9BQ674R7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9BQ674R7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9BQ674R7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9BQ674R7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG9BQ674R7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG9BQ674R7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9BQ674R7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9BQ674R7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9BQ674R7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9BQ674R7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9BQ674R7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9BQ674R7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG9BQ674R7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG9BQ674R7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9BQ674R7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9BQ674R7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG9BQ674R7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9BQ674R7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9BQ674R7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9BQ674R7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG9BQ674R7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG9BQ674R7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9BQ674R7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9BQ674R7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9BQ674R7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG9BQ674R7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATG9BQ674R7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9BQ674R7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9BQ674R7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9BQ674R7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9BQ674R7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms