Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF3Q5TH69 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF3Q5TH69 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF3Q5TH69 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF3Q5TH69 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF3Q5TH69 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF3Q5TH69 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF3Q5TH69 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF3Q5TH69 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF3Q5TH69 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF3Q5TH69 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF3Q5TH69 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF3Q5TH69 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF3Q5TH69 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF3Q5TH69 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF3Q5TH69 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF3Q5TH69 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF3Q5TH69 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF3Q5TH69 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF3Q5TH69 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF3Q5TH69 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF3Q5TH69 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF3Q5TH69 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF3Q5TH69 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF3Q5TH69 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF3Q5TH69 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF3Q5TH69 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFGEF3Q5TH69 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARFGEF3Q5TH69 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFGEF3Q5TH69 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF3Q5TH69 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF3Q5TH69 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF3Q5TH69 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF3Q5TH69 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF3Q5TH69 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF3Q5TH69 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF3Q5TH69 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF3Q5TH69 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF3Q5TH69 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF3Q5TH69 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF3Q5TH69 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF3Q5TH69 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF3Q5TH69 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF3Q5TH69 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF3Q5TH69 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGEF3Q5TH69 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGEF3Q5TH69 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGEF3Q5TH69 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGEF3Q5TH69 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGEF3Q5TH69 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF3Q5TH69 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF3Q5TH69 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF3Q5TH69 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF3Q5TH69 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFGEF3Q5TH69 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF3Q5TH69 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF3Q5TH69 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF3Q5TH69 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF3Q5TH69 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF3Q5TH69 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF3Q5TH69 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF3Q5TH69 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF3Q5TH69 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF3Q5TH69 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGEF3Q5TH69 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF3Q5TH69 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF3Q5TH69 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGEF3Q5TH69 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGEF3Q5TH69 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGEF3Q5TH69 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGEF3Q5TH69 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGEF3Q5TH69 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGEF3Q5TH69 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGEF3Q5TH69 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGEF3Q5TH69 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGEF3Q5TH69 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARFGEF3Q5TH69 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFGEF3Q5TH69 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGEF3Q5TH69 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGEF3Q5TH69 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGEF3Q5TH69 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGEF3Q5TH69 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFGEF3Q5TH69 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF3Q5TH69 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF3Q5TH69 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF3Q5TH69 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms