Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
XKR4Q5GH76 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
XKR4Q5GH76 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
XKR4Q5GH76 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
XKR4Q5GH76 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
XKR4Q5GH76 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
XKR4Q5GH76 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
XKR4Q5GH76 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
XKR4Q5GH76 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
XKR4Q5GH76 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
XKR4Q5GH76 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
XKR4Q5GH76 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
XKR4Q5GH76 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
XKR4Q5GH76 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
XKR4Q5GH76 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
XKR4Q5GH76 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
XKR4Q5GH76 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
XKR4Q5GH76 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
XKR4Q5GH76 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
XKR4Q5GH76 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
XKR4Q5GH76 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
XKR4Q5GH76 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
XKR4Q5GH76 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
XKR4Q5GH76 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
XKR4Q5GH76 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
XKR4Q5GH76 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
XKR4Q5GH76 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
XKR4Q5GH76 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
XKR4Q5GH76 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
XKR4Q5GH76 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
XKR4Q5GH76 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
XKR4Q5GH76 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
XKR4Q5GH76 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
XKR4Q5GH76 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
XKR4Q5GH76 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
XKR4Q5GH76 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
XKR4Q5GH76 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
XKR4Q5GH76 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
XKR4Q5GH76 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
XKR4Q5GH76 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
XKR4Q5GH76 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XKR4Q5GH76 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
XKR4Q5GH76 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
XKR4Q5GH76 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
XKR4Q5GH76 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
XKR4Q5GH76 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
XKR4Q5GH76 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
XKR4Q5GH76 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XKR4Q5GH76 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
XKR4Q5GH76 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
XKR4Q5GH76 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
XKR4Q5GH76 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
XKR4Q5GH76 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
XKR4Q5GH76 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
XKR4Q5GH76 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
XKR4Q5GH76 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XKR4Q5GH76 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XKR4Q5GH76 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
XKR4Q5GH76 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
XKR4Q5GH76 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
XKR4Q5GH76 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
XKR4Q5GH76 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
XKR4Q5GH76 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
XKR4Q5GH76 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
XKR4Q5GH76 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
XKR4Q5GH76 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XKR4Q5GH76 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XKR4Q5GH76 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XKR4Q5GH76 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XKR4Q5GH76 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
XKR4Q5GH76 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XKR4Q5GH76 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
XKR4Q5GH76 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XKR4Q5GH76 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XKR4Q5GH76 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XKR4Q5GH76 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XKR4Q5GH76 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XKR4Q5GH76 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XKR4Q5GH76 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XKR4Q5GH76 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
XKR4Q5GH76 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
XKR4Q5GH76 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
XKR4Q5GH76 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
XKR4Q5GH76 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
XKR4Q5GH76 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
XKR4Q5GH76 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
XKR4Q5GH76 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
XKR4Q5GH76 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XKR4Q5GH76 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
XKR4Q5GH76 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XKR4Q5GH76 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XKR4Q5GH76 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XKR4Q5GH76 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XKR4Q5GH76 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
XKR4Q5GH76 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XKR4Q5GH76 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XKR4Q5GH76 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XKR4Q5GH76 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XKR4Q5GH76 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XKR4Q5GH76 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms