Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HSP90AA4PQ58FG1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HSP90AA4PQ58FG1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HSP90AA4PQ58FG1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HSP90AA4PQ58FG1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HSP90AA4PQ58FG1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
HSP90AA4PQ58FG1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HSP90AA4PQ58FG1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HSP90AA4PQ58FG1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HSP90AA4PQ58FG1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
HSP90AA4PQ58FG1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HSP90AA4PQ58FG1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HSP90AA4PQ58FG1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HSP90AA4PQ58FG1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
HSP90AA4PQ58FG1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HSP90AA4PQ58FG1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HSP90AA4PQ58FG1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HSP90AA4PQ58FG1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HSP90AA4PQ58FG1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HSP90AA4PQ58FG1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HSP90AA4PQ58FG1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HSP90AA4PQ58FG1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HSP90AA4PQ58FG1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HSP90AA4PQ58FG1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HSP90AA4PQ58FG1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HSP90AA4PQ58FG1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HSP90AA4PQ58FG1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HSP90AA4PQ58FG1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HSP90AA4PQ58FG1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
HSP90AA4PQ58FG1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HSP90AA4PQ58FG1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
HSP90AA4PQ58FG1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HSP90AA4PQ58FG1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HSP90AA4PQ58FG1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HSP90AA4PQ58FG1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HSP90AA4PQ58FG1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HSP90AA4PQ58FG1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HSP90AA4PQ58FG1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HSP90AA4PQ58FG1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HSP90AA4PQ58FG1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HSP90AA4PQ58FG1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HSP90AA4PQ58FG1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
HSP90AA4PQ58FG1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HSP90AA4PQ58FG1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HSP90AA4PQ58FG1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HSP90AA4PQ58FG1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HSP90AA4PQ58FG1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HSP90AA4PQ58FG1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HSP90AA4PQ58FG1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HSP90AA4PQ58FG1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HSP90AA4PQ58FG1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
HSP90AA4PQ58FG1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HSP90AA4PQ58FG1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HSP90AA4PQ58FG1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HSP90AA4PQ58FG1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HSP90AA4PQ58FG1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HSP90AA4PQ58FG1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HSP90AA4PQ58FG1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HSP90AA4PQ58FG1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HSP90AA4PQ58FG1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
HSP90AA4PQ58FG1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HSP90AA4PQ58FG1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HSP90AA4PQ58FG1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
HSP90AA4PQ58FG1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HSP90AA4PQ58FG1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HSP90AA4PQ58FG1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HSP90AA4PQ58FG1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HSP90AA4PQ58FG1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HSP90AA4PQ58FG1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HSP90AA4PQ58FG1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HSP90AA4PQ58FG1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HSP90AA4PQ58FG1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HSP90AA4PQ58FG1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HSP90AA4PQ58FG1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HSP90AA4PQ58FG1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HSP90AA4PQ58FG1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HSP90AA4PQ58FG1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HSP90AA4PQ58FG1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
HSP90AA4PQ58FG1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HSP90AA4PQ58FG1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HSP90AA4PQ58FG1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HSP90AA4PQ58FG1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HSP90AA4PQ58FG1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HSP90AA4PQ58FG1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms