Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
NBPF1Q3BBV0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
NBPF1Q3BBV0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
NBPF1Q3BBV0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
NBPF1Q3BBV0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
NBPF1Q3BBV0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NBPF1Q3BBV0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
NBPF1Q3BBV0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
NBPF1Q3BBV0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NBPF1Q3BBV0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NBPF1Q3BBV0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NBPF1Q3BBV0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NBPF1Q3BBV0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NBPF1Q3BBV0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
NBPF1Q3BBV0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
NBPF1Q3BBV0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NBPF1Q3BBV0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NBPF1Q3BBV0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
NBPF1Q3BBV0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
NBPF1Q3BBV0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NBPF1Q3BBV0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NBPF1Q3BBV0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NBPF1Q3BBV0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
NBPF1Q3BBV0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
NBPF1Q3BBV0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
NBPF1Q3BBV0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NBPF1Q3BBV0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NBPF1Q3BBV0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NBPF1Q3BBV0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NBPF1Q3BBV0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NBPF1Q3BBV0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NBPF1Q3BBV0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NBPF1Q3BBV0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NBPF1Q3BBV0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
NBPF1Q3BBV0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NBPF1Q3BBV0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NBPF1Q3BBV0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
NBPF1Q3BBV0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NBPF1Q3BBV0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NBPF1Q3BBV0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NBPF1Q3BBV0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NBPF1Q3BBV0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NBPF1Q3BBV0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NBPF1Q3BBV0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
NBPF1Q3BBV0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NBPF1Q3BBV0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NBPF1Q3BBV0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NBPF1Q3BBV0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NBPF1Q3BBV0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NBPF1Q3BBV0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NBPF1Q3BBV0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NBPF1Q3BBV0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
NBPF1Q3BBV0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NBPF1Q3BBV0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NBPF1Q3BBV0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NBPF1Q3BBV0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NBPF1Q3BBV0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NBPF1Q3BBV0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
NBPF1Q3BBV0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NBPF1Q3BBV0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NBPF1Q3BBV0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NBPF1Q3BBV0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
NBPF1Q3BBV0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
NBPF1Q3BBV0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NBPF1Q3BBV0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NBPF1Q3BBV0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
NBPF1Q3BBV0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
NBPF1Q3BBV0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
NBPF1Q3BBV0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NBPF1Q3BBV0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NBPF1Q3BBV0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
NBPF1Q3BBV0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NBPF1Q3BBV0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
NBPF1Q3BBV0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NBPF1Q3BBV0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
NBPF1Q3BBV0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
NBPF1Q3BBV0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NBPF1Q3BBV0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NBPF1Q3BBV0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NBPF1Q3BBV0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NBPF1Q3BBV0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NBPF1Q3BBV0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NBPF1Q3BBV0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NBPF1Q3BBV0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
NBPF1Q3BBV0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NBPF1Q3BBV0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NBPF1Q3BBV0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NBPF1Q3BBV0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NBPF1Q3BBV0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
NBPF1Q3BBV0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
NBPF1Q3BBV0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.82
NBPF1Q3BBV0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
NBPF1Q3BBV0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NBPF1Q3BBV0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NBPF1Q3BBV0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NBPF1Q3BBV0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
NBPF1Q3BBV0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
NBPF1Q3BBV0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
NBPF1Q3BBV0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms