Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R3AQ16821 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R3AQ16821 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R3AQ16821 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R3AQ16821 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R3AQ16821 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R3AQ16821 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R3AQ16821 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R3AQ16821 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R3AQ16821 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R3AQ16821 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R3AQ16821 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R3AQ16821 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R3AQ16821 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R3AQ16821 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R3AQ16821 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R3AQ16821 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R3AQ16821 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R3AQ16821 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R3AQ16821 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R3AQ16821 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R3AQ16821 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R3AQ16821 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R3AQ16821 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R3AQ16821 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP1R3AQ16821 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP1R3AQ16821 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R3AQ16821 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R3AQ16821 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R3AQ16821 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP1R3AQ16821 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP1R3AQ16821 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP1R3AQ16821 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP1R3AQ16821 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP1R3AQ16821 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP1R3AQ16821 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R3AQ16821 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R3AQ16821 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R3AQ16821 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R3AQ16821 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R3AQ16821 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R3AQ16821 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPP1R3AQ16821 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP1R3AQ16821 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP1R3AQ16821 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPP1R3AQ16821 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1R3AQ16821 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPP1R3AQ16821 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP1R3AQ16821 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP1R3AQ16821 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP1R3AQ16821 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1R3AQ16821 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1R3AQ16821 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R3AQ16821 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R3AQ16821 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP1R3AQ16821 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP1R3AQ16821 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPP1R3AQ16821 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP1R3AQ16821 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP1R3AQ16821 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R3AQ16821 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R3AQ16821 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R3AQ16821 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R3AQ16821 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R3AQ16821 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms