Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PPP1R3AQ16821 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPP1R3AQ16821 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PPP1R3AQ16821 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PPP1R3AQ16821 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PPP1R3AQ16821 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPP1R3AQ16821 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPP1R3AQ16821 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPP1R3AQ16821 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PPP1R3AQ16821 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PPP1R3AQ16821 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PPP1R3AQ16821 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PPP1R3AQ16821 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PPP1R3AQ16821 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPP1R3AQ16821 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PPP1R3AQ16821 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPP1R3AQ16821 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPP1R3AQ16821 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPP1R3AQ16821 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PPP1R3AQ16821 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPP1R3AQ16821 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPP1R3AQ16821 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPP1R3AQ16821 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PPP1R3AQ16821 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPP1R3AQ16821 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPP1R3AQ16821 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPP1R3AQ16821 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPP1R3AQ16821 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPP1R3AQ16821 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPP1R3AQ16821 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPP1R3AQ16821 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PPP1R3AQ16821 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PPP1R3AQ16821 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPP1R3AQ16821 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PPP1R3AQ16821 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPP1R3AQ16821 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPP1R3AQ16821 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPP1R3AQ16821 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPP1R3AQ16821 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPP1R3AQ16821 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPP1R3AQ16821 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPP1R3AQ16821 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP1R3AQ16821 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPP1R3AQ16821 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPP1R3AQ16821 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPP1R3AQ16821 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP1R3AQ16821 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP1R3AQ16821 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP1R3AQ16821 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP1R3AQ16821 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R3AQ16821 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPP1R3AQ16821 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPP1R3AQ16821 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP1R3AQ16821 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP1R3AQ16821 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPP1R3AQ16821 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPP1R3AQ16821 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPP1R3AQ16821 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPP1R3AQ16821 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP1R3AQ16821 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP1R3AQ16821 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP1R3AQ16821 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R3AQ16821 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP1R3AQ16821 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R3AQ16821 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R3AQ16821 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R3AQ16821 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R3AQ16821 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R3AQ16821 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R3AQ16821 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R3AQ16821 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R3AQ16821 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R3AQ16821 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R3AQ16821 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R3AQ16821 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R3AQ16821 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPP1R3AQ16821 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R3AQ16821 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R3AQ16821 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R3AQ16821 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R3AQ16821 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R3AQ16821 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R3AQ16821 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R3AQ16821 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R3AQ16821 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R3AQ16821 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R3AQ16821 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R3AQ16821 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R3AQ16821 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R3AQ16821 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R3AQ16821 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R3AQ16821 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R3AQ16821 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R3AQ16821 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R3AQ16821 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R3AQ16821 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R3AQ16821 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R3AQ16821 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R3AQ16821 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R3AQ16821 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
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