Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms