Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2Q16385 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2Q16385 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2Q16385 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2Q16385 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2Q16385 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2Q16385 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2Q16385 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX2Q16385 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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