Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB35Q15286 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB35Q15286 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB35Q15286 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB35Q15286 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB35Q15286 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB35Q15286 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB35Q15286 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB35Q15286 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB35Q15286 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB35Q15286 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB35Q15286 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB35Q15286 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB35Q15286 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB35Q15286 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB35Q15286 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB35Q15286 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB35Q15286 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB35Q15286 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB35Q15286 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB35Q15286 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB35Q15286 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB35Q15286 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB35Q15286 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB35Q15286 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB35Q15286 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB35Q15286 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB35Q15286 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB35Q15286 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB35Q15286 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB35Q15286 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB35Q15286 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB35Q15286 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB35Q15286 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB35Q15286 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB35Q15286 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB35Q15286 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB35Q15286 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB35Q15286 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB35Q15286 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB35Q15286 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB35Q15286 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB35Q15286 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB35Q15286 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB35Q15286 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB35Q15286 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB35Q15286 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB35Q15286 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB35Q15286 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB35Q15286 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB35Q15286 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB35Q15286 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB35Q15286 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB35Q15286 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB35Q15286 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB35Q15286 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB35Q15286 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB35Q15286 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB35Q15286 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB35Q15286 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB35Q15286 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB35Q15286 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms