Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC3Q15034 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC3Q15034 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC3Q15034 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC3Q15034 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC3Q15034 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC3Q15034 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC3Q15034 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC3Q15034 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC3Q15034 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC3Q15034 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC3Q15034 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC3Q15034 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC3Q15034 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC3Q15034 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC3Q15034 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC3Q15034 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC3Q15034 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC3Q15034 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC3Q15034 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC3Q15034 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC3Q15034 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC3Q15034 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC3Q15034 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC3Q15034 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERC3Q15034 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC3Q15034 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC3Q15034 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC3Q15034 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC3Q15034 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC3Q15034 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC3Q15034 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC3Q15034 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC3Q15034 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC3Q15034 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC3Q15034 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC3Q15034 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC3Q15034 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC3Q15034 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC3Q15034 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HERC3Q15034 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HERC3Q15034 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HERC3Q15034 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC3Q15034 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC3Q15034 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC3Q15034 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC3Q15034 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HERC3Q15034 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC3Q15034 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC3Q15034 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC3Q15034 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC3Q15034 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC3Q15034 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC3Q15034 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC3Q15034 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HERC3Q15034 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC3Q15034 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC3Q15034 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC3Q15034 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC3Q15034 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC3Q15034 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC3Q15034 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC3Q15034 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC3Q15034 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC3Q15034 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC3Q15034 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC3Q15034 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC3Q15034 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC3Q15034 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC3Q15034 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC3Q15034 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC3Q15034 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC3Q15034 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HERC3Q15034 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC3Q15034 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC3Q15034 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC3Q15034 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC3Q15034 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC3Q15034 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC3Q15034 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC3Q15034 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC3Q15034 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC3Q15034 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERC3Q15034 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC3Q15034 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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