Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HERC3Q15034 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HERC3Q15034 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HERC3Q15034 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HERC3Q15034 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HERC3Q15034 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
HERC3Q15034 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HERC3Q15034 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HERC3Q15034 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HERC3Q15034 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HERC3Q15034 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HERC3Q15034 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HERC3Q15034 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HERC3Q15034 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HERC3Q15034 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HERC3Q15034 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HERC3Q15034 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HERC3Q15034 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
HERC3Q15034 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HERC3Q15034 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HERC3Q15034 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HERC3Q15034 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HERC3Q15034 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HERC3Q15034 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HERC3Q15034 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HERC3Q15034 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HERC3Q15034 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HERC3Q15034 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HERC3Q15034 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HERC3Q15034 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HERC3Q15034 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HERC3Q15034 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HERC3Q15034 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HERC3Q15034 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HERC3Q15034 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERC3Q15034 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HERC3Q15034 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HERC3Q15034 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HERC3Q15034 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HERC3Q15034 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HERC3Q15034 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERC3Q15034 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HERC3Q15034 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HERC3Q15034 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HERC3Q15034 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HERC3Q15034 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HERC3Q15034 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HERC3Q15034 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HERC3Q15034 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HERC3Q15034 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HERC3Q15034 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HERC3Q15034 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HERC3Q15034 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HERC3Q15034 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERC3Q15034 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC3Q15034 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC3Q15034 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERC3Q15034 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC3Q15034 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERC3Q15034 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERC3Q15034 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERC3Q15034 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERC3Q15034 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERC3Q15034 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC3Q15034 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC3Q15034 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HERC3Q15034 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC3Q15034 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HERC3Q15034 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HERC3Q15034 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC3Q15034 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC3Q15034 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC3Q15034 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HERC3Q15034 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC3Q15034 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC3Q15034 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERC3Q15034 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC3Q15034 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC3Q15034 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERC3Q15034 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC3Q15034 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HERC3Q15034 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERC3Q15034 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERC3Q15034 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC3Q15034 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERC3Q15034 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERC3Q15034 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERC3Q15034 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERC3Q15034 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC3Q15034 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC3Q15034 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC3Q15034 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC3Q15034 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC3Q15034 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC3Q15034 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERC3Q15034 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HERC3Q15034 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HERC3Q15034 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERC3Q15034 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC3Q15034 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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