Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NWD1Q149M9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NWD1Q149M9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
NWD1Q149M9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
NWD1Q149M9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
NWD1Q149M9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
NWD1Q149M9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NWD1Q149M9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NWD1Q149M9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NWD1Q149M9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NWD1Q149M9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NWD1Q149M9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NWD1Q149M9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NWD1Q149M9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
NWD1Q149M9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
NWD1Q149M9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NWD1Q149M9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NWD1Q149M9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NWD1Q149M9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
NWD1Q149M9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
NWD1Q149M9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
NWD1Q149M9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NWD1Q149M9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NWD1Q149M9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
NWD1Q149M9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NWD1Q149M9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NWD1Q149M9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NWD1Q149M9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
NWD1Q149M9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
NWD1Q149M9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
NWD1Q149M9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
NWD1Q149M9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.02■■■■■ 4
NWD1Q149M9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
NWD1Q149M9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
NWD1Q149M9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
NWD1Q149M9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
NWD1Q149M9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
NWD1Q149M9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
NWD1Q149M9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NWD1Q149M9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
NWD1Q149M9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
NWD1Q149M9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NWD1Q149M9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NWD1Q149M9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NWD1Q149M9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NWD1Q149M9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
NWD1Q149M9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
NWD1Q149M9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NWD1Q149M9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
NWD1Q149M9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NWD1Q149M9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NWD1Q149M9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
NWD1Q149M9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
NWD1Q149M9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
NWD1Q149M9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.95
NWD1Q149M9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NWD1Q149M9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NWD1Q149M9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
NWD1Q149M9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NWD1Q149M9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
NWD1Q149M9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NWD1Q149M9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
NWD1Q149M9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
NWD1Q149M9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NWD1Q149M9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NWD1Q149M9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NWD1Q149M9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NWD1Q149M9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NWD1Q149M9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
NWD1Q149M9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
NWD1Q149M9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NWD1Q149M9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NWD1Q149M9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NWD1Q149M9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NWD1Q149M9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NWD1Q149M9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
NWD1Q149M9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NWD1Q149M9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
NWD1Q149M9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.5■■■■□ 3.91
NWD1Q149M9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NWD1Q149M9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
NWD1Q149M9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NWD1Q149M9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
NWD1Q149M9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NWD1Q149M9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NWD1Q149M9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NWD1Q149M9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NWD1Q149M9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NWD1Q149M9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NWD1Q149M9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NWD1Q149M9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NWD1Q149M9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NWD1Q149M9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NWD1Q149M9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
NWD1Q149M9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.32■■■■□ 3.88
NWD1Q149M9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NWD1Q149M9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NWD1Q149M9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
NWD1Q149M9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NWD1Q149M9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
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