Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERV3-1Q14264 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERV3-1Q14264 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERV3-1Q14264 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERV3-1Q14264 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERV3-1Q14264 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERV3-1Q14264 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERV3-1Q14264 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERV3-1Q14264 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERV3-1Q14264 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERV3-1Q14264 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERV3-1Q14264 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERV3-1Q14264 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERV3-1Q14264 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERV3-1Q14264 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERV3-1Q14264 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERV3-1Q14264 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERV3-1Q14264 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERV3-1Q14264 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERV3-1Q14264 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERV3-1Q14264 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERV3-1Q14264 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERV3-1Q14264 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERV3-1Q14264 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERV3-1Q14264 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERV3-1Q14264 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERV3-1Q14264 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERV3-1Q14264 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERV3-1Q14264 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERV3-1Q14264 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERV3-1Q14264 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERV3-1Q14264 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERV3-1Q14264 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERV3-1Q14264 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERV3-1Q14264 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERV3-1Q14264 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERV3-1Q14264 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERV3-1Q14264 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERV3-1Q14264 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERV3-1Q14264 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERV3-1Q14264 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERV3-1Q14264 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERV3-1Q14264 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERV3-1Q14264 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERV3-1Q14264 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERV3-1Q14264 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERV3-1Q14264 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERV3-1Q14264 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERV3-1Q14264 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERV3-1Q14264 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERV3-1Q14264 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERV3-1Q14264 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERV3-1Q14264 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERV3-1Q14264 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERV3-1Q14264 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERV3-1Q14264 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERV3-1Q14264 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERV3-1Q14264 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERV3-1Q14264 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERV3-1Q14264 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERV3-1Q14264 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERV3-1Q14264 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERV3-1Q14264 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERV3-1Q14264 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERV3-1Q14264 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERV3-1Q14264 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERV3-1Q14264 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERV3-1Q14264 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERV3-1Q14264 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ERV3-1Q14264 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERV3-1Q14264 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERV3-1Q14264 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERV3-1Q14264 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERV3-1Q14264 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERV3-1Q14264 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERV3-1Q14264 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERV3-1Q14264 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERV3-1Q14264 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERV3-1Q14264 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERV3-1Q14264 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERV3-1Q14264 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERV3-1Q14264 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERV3-1Q14264 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERV3-1Q14264 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERV3-1Q14264 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERV3-1Q14264 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERV3-1Q14264 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms