Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARB2Q14108 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARB2Q14108 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARB2Q14108 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARB2Q14108 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARB2Q14108 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARB2Q14108 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARB2Q14108 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARB2Q14108 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARB2Q14108 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARB2Q14108 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARB2Q14108 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARB2Q14108 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARB2Q14108 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARB2Q14108 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARB2Q14108 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARB2Q14108 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARB2Q14108 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCARB2Q14108 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARB2Q14108 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARB2Q14108 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARB2Q14108 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARB2Q14108 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARB2Q14108 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARB2Q14108 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARB2Q14108 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARB2Q14108 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARB2Q14108 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARB2Q14108 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARB2Q14108 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARB2Q14108 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARB2Q14108 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARB2Q14108 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARB2Q14108 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARB2Q14108 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARB2Q14108 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARB2Q14108 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARB2Q14108 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARB2Q14108 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARB2Q14108 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARB2Q14108 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARB2Q14108 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARB2Q14108 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARB2Q14108 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCARB2Q14108 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCARB2Q14108 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARB2Q14108 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARB2Q14108 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARB2Q14108 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARB2Q14108 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARB2Q14108 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARB2Q14108 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARB2Q14108 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARB2Q14108 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARB2Q14108 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARB2Q14108 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARB2Q14108 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARB2Q14108 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARB2Q14108 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARB2Q14108 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARB2Q14108 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARB2Q14108 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARB2Q14108 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARB2Q14108 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARB2Q14108 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARB2Q14108 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARB2Q14108 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARB2Q14108 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARB2Q14108 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARB2Q14108 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARB2Q14108 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARB2Q14108 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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