Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCARB2Q14108 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCARB2Q14108 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCARB2Q14108 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SCARB2Q14108 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCARB2Q14108 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCARB2Q14108 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCARB2Q14108 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCARB2Q14108 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCARB2Q14108 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCARB2Q14108 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCARB2Q14108 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCARB2Q14108 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCARB2Q14108 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCARB2Q14108 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCARB2Q14108 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARB2Q14108 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCARB2Q14108 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCARB2Q14108 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCARB2Q14108 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCARB2Q14108 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCARB2Q14108 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCARB2Q14108 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCARB2Q14108 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCARB2Q14108 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCARB2Q14108 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCARB2Q14108 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCARB2Q14108 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCARB2Q14108 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCARB2Q14108 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCARB2Q14108 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCARB2Q14108 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCARB2Q14108 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCARB2Q14108 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCARB2Q14108 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCARB2Q14108 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCARB2Q14108 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCARB2Q14108 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCARB2Q14108 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCARB2Q14108 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCARB2Q14108 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCARB2Q14108 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCARB2Q14108 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCARB2Q14108 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCARB2Q14108 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARB2Q14108 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARB2Q14108 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARB2Q14108 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCARB2Q14108 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCARB2Q14108 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCARB2Q14108 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARB2Q14108 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCARB2Q14108 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCARB2Q14108 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCARB2Q14108 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCARB2Q14108 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCARB2Q14108 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARB2Q14108 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARB2Q14108 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCARB2Q14108 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCARB2Q14108 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARB2Q14108 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCARB2Q14108 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCARB2Q14108 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SCARB2Q14108 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCARB2Q14108 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARB2Q14108 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARB2Q14108 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARB2Q14108 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARB2Q14108 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCARB2Q14108 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARB2Q14108 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARB2Q14108 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARB2Q14108 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARB2Q14108 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARB2Q14108 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCARB2Q14108 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARB2Q14108 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARB2Q14108 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARB2Q14108 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARB2Q14108 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARB2Q14108 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARB2Q14108 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARB2Q14108 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARB2Q14108 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCARB2Q14108 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARB2Q14108 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARB2Q14108 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARB2Q14108 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARB2Q14108 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARB2Q14108 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARB2Q14108 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARB2Q14108 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARB2Q14108 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCARB2Q14108 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARB2Q14108 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARB2Q14108 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARB2Q14108 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARB2Q14108 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARB2Q14108 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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