Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
CDK13Q14004 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
CDK13Q14004 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
CDK13Q14004 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
CDK13Q14004 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
CDK13Q14004 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
CDK13Q14004 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
CDK13Q14004 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CDK13Q14004 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
CDK13Q14004 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
CDK13Q14004 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
CDK13Q14004 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CDK13Q14004 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
CDK13Q14004 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
CDK13Q14004 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
CDK13Q14004 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CDK13Q14004 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CDK13Q14004 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CDK13Q14004 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CDK13Q14004 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CDK13Q14004 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
CDK13Q14004 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
CDK13Q14004 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CDK13Q14004 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CDK13Q14004 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CDK13Q14004 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.63
CDK13Q14004 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
CDK13Q14004 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
CDK13Q14004 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CDK13Q14004 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
CDK13Q14004 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CDK13Q14004 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CDK13Q14004 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CDK13Q14004 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
CDK13Q14004 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CDK13Q14004 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CDK13Q14004 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CDK13Q14004 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
CDK13Q14004 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CDK13Q14004 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CDK13Q14004 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CDK13Q14004 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CDK13Q14004 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
CDK13Q14004 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CDK13Q14004 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
CDK13Q14004 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CDK13Q14004 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
CDK13Q14004 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CDK13Q14004 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CDK13Q14004 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CDK13Q14004 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CDK13Q14004 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CDK13Q14004 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
CDK13Q14004 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CDK13Q14004 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
CDK13Q14004 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
CDK13Q14004 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
CDK13Q14004 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CDK13Q14004 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CDK13Q14004 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.56
CDK13Q14004 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CDK13Q14004 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CDK13Q14004 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
CDK13Q14004 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CDK13Q14004 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CDK13Q14004 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
CDK13Q14004 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CDK13Q14004 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CDK13Q14004 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
CDK13Q14004 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.44■■■■■ 4.54
CDK13Q14004 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
CDK13Q14004 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CDK13Q14004 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CDK13Q14004 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CDK13Q14004 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
CDK13Q14004 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CDK13Q14004 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
CDK13Q14004 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CDK13Q14004 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
CDK13Q14004 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CDK13Q14004 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
CDK13Q14004 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CDK13Q14004 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.52
CDK13Q14004 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
CDK13Q14004 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CDK13Q14004 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CDK13Q14004 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CDK13Q14004 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CDK13Q14004 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CDK13Q14004 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CDK13Q14004 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
CDK13Q14004 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
CDK13Q14004 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
CDK13Q14004 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
CDK13Q14004 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
CDK13Q14004 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CDK13Q14004 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CDK13Q14004 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
CDK13Q14004 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CDK13Q14004 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
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