Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
SHROOM2Q13796 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC46.27■■■■■ 5
SHROOM2Q13796 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
SHROOM2Q13796 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
SHROOM2Q13796 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
SHROOM2Q13796 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
SHROOM2Q13796 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC46.25■■■■■ 4.99
SHROOM2Q13796 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
SHROOM2Q13796 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
SHROOM2Q13796 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC46.17■■■■■ 4.98
SHROOM2Q13796 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
SHROOM2Q13796 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC46.15■■■■■ 4.98
SHROOM2Q13796 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
SHROOM2Q13796 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
SHROOM2Q13796 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
SHROOM2Q13796 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
SHROOM2Q13796 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
SHROOM2Q13796 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC46.09■■■■■ 4.97
SHROOM2Q13796 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC46.08■■■■■ 4.97
SHROOM2Q13796 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC46.07■■■■■ 4.97
SHROOM2Q13796 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
SHROOM2Q13796 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
SHROOM2Q13796 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
SHROOM2Q13796 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46■■■■■ 4.95
SHROOM2Q13796 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
SHROOM2Q13796 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.97■■■■■ 4.95
SHROOM2Q13796 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
SHROOM2Q13796 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC45.96■■■■■ 4.95
SHROOM2Q13796 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
SHROOM2Q13796 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
SHROOM2Q13796 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
SHROOM2Q13796 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
SHROOM2Q13796 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
SHROOM2Q13796 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC45.86■■■■■ 4.93
SHROOM2Q13796 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.84■■■■■ 4.93
SHROOM2Q13796 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
SHROOM2Q13796 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
SHROOM2Q13796 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
SHROOM2Q13796 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC45.8■■■■■ 4.92
SHROOM2Q13796 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
SHROOM2Q13796 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.78■■■■■ 4.92
SHROOM2Q13796 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
SHROOM2Q13796 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
SHROOM2Q13796 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.71■■■■■ 4.91
SHROOM2Q13796 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
SHROOM2Q13796 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC45.65■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
SHROOM2Q13796 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
SHROOM2Q13796 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
SHROOM2Q13796 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
SHROOM2Q13796 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
SHROOM2Q13796 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
SHROOM2Q13796 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
SHROOM2Q13796 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
SHROOM2Q13796 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
SHROOM2Q13796 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
SHROOM2Q13796 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC45.47■■■■■ 4.87
SHROOM2Q13796 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC45.4■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
SHROOM2Q13796 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
SHROOM2Q13796 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
SHROOM2Q13796 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
SHROOM2Q13796 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.27■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
SHROOM2Q13796 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.23■■■■■ 4.83
SHROOM2Q13796 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
SHROOM2Q13796 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
SHROOM2Q13796 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC45.15■■■■■ 4.82
SHROOM2Q13796 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
SHROOM2Q13796 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
SHROOM2Q13796 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
SHROOM2Q13796 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC45.08■■■■■ 4.81
SHROOM2Q13796 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
SHROOM2Q13796 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
SHROOM2Q13796 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
SHROOM2Q13796 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
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