Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC56.77■■■■■ 6.68
SHROOM2Q13796 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC56.43■■■■■ 6.62
SHROOM2Q13796 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC56.11■■■■■ 6.57
SHROOM2Q13796 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.3■■■■■ 6.44
SHROOM2Q13796 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.57■■■■■ 6.33
SHROOM2Q13796 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
SHROOM2Q13796 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.14■■■■■ 6.26
SHROOM2Q13796 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC54.09■■■■■ 6.25
SHROOM2Q13796 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.97■■■■■ 6.23
SHROOM2Q13796 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
SHROOM2Q13796 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
SHROOM2Q13796 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC53.75■■■■■ 6.19
SHROOM2Q13796 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC53.59■■■■■ 6.17
SHROOM2Q13796 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.37■■■■■ 6.13
SHROOM2Q13796 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.33■■■■■ 6.13
SHROOM2Q13796 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.32■■■■■ 6.13
SHROOM2Q13796 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53■■■■■ 6.08
SHROOM2Q13796 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.69■■■■■ 6.03
SHROOM2Q13796 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.66■■■■■ 6.02
SHROOM2Q13796 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6
SHROOM2Q13796 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.45■■■■■ 5.99
SHROOM2Q13796 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC52.45■■■■■ 5.99
SHROOM2Q13796 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC52.28■■■■■ 5.96
SHROOM2Q13796 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.96
SHROOM2Q13796 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
SHROOM2Q13796 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.06■■■■■ 5.92
SHROOM2Q13796 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC51.98■■■■■ 5.91
SHROOM2Q13796 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC51.93■■■■■ 5.9
SHROOM2Q13796 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC51.93■■■■■ 5.9
SHROOM2Q13796 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC51.79■■■■■ 5.88
SHROOM2Q13796 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.77■■■■■ 5.88
SHROOM2Q13796 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
SHROOM2Q13796 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC51.28■■■■■ 5.8
SHROOM2Q13796 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
SHROOM2Q13796 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC51.14■■■■■ 5.78
SHROOM2Q13796 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.08■■■■■ 5.77
SHROOM2Q13796 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
SHROOM2Q13796 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC50.82■■■■■ 5.73
SHROOM2Q13796 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.59■■■■■ 5.69
SHROOM2Q13796 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
SHROOM2Q13796 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.42■■■■■ 5.66
SHROOM2Q13796 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.39■■■■■ 5.66
SHROOM2Q13796 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
SHROOM2Q13796 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC50.33■■■■■ 5.65
SHROOM2Q13796 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC50.23■■■■■ 5.63
SHROOM2Q13796 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC50.21■■■■■ 5.63
SHROOM2Q13796 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
SHROOM2Q13796 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC50.04■■■■■ 5.6
SHROOM2Q13796 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC50.04■■■■■ 5.6
SHROOM2Q13796 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC50.03■■■■■ 5.6
SHROOM2Q13796 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
SHROOM2Q13796 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC49.99■■■■■ 5.59
SHROOM2Q13796 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
SHROOM2Q13796 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
SHROOM2Q13796 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC49.9■■■■■ 5.58
SHROOM2Q13796 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC49.88■■■■■ 5.58
SHROOM2Q13796 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
SHROOM2Q13796 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.81■■■■■ 5.56
SHROOM2Q13796 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.68■■■■■ 5.54
SHROOM2Q13796 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.63■■■■■ 5.54
SHROOM2Q13796 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.53
SHROOM2Q13796 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
SHROOM2Q13796 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
SHROOM2Q13796 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
SHROOM2Q13796 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
SHROOM2Q13796 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC49.5■■■■■ 5.51
SHROOM2Q13796 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC49.36■■■■■ 5.49
SHROOM2Q13796 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
SHROOM2Q13796 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
SHROOM2Q13796 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
SHROOM2Q13796 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
SHROOM2Q13796 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC49.14■■■■■ 5.46
SHROOM2Q13796 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
SHROOM2Q13796 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC49.06■■■■■ 5.44
SHROOM2Q13796 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC49.05■■■■■ 5.44
SHROOM2Q13796 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC49.03■■■■■ 5.44
SHROOM2Q13796 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
SHROOM2Q13796 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
SHROOM2Q13796 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
SHROOM2Q13796 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
SHROOM2Q13796 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC48.92■■■■■ 5.42
SHROOM2Q13796 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
SHROOM2Q13796 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC48.87■■■■■ 5.41
SHROOM2Q13796 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.86■■■■■ 5.41
SHROOM2Q13796 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC48.85■■■■■ 5.41
SHROOM2Q13796 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
SHROOM2Q13796 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC48.79■■■■■ 5.4
SHROOM2Q13796 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
SHROOM2Q13796 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
SHROOM2Q13796 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC48.77■■■■■ 5.4
SHROOM2Q13796 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC48.77■■■■■ 5.4
SHROOM2Q13796 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC48.77■■■■■ 5.4
SHROOM2Q13796 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC48.71■■■■■ 5.39
SHROOM2Q13796 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
SHROOM2Q13796 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC48.68■■■■■ 5.38
SHROOM2Q13796 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC48.65■■■■■ 5.38
SHROOM2Q13796 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.64■■■■■ 5.38
SHROOM2Q13796 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
SHROOM2Q13796 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
SHROOM2Q13796 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC48.61■■■■■ 5.37
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