Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PTCH1Q13635 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
PTCH1Q13635 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PTCH1Q13635 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PTCH1Q13635 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PTCH1Q13635 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PTCH1Q13635 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PTCH1Q13635 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PTCH1Q13635 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PTCH1Q13635 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PTCH1Q13635 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PTCH1Q13635 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PTCH1Q13635 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTCH1Q13635 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTCH1Q13635 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PTCH1Q13635 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PTCH1Q13635 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PTCH1Q13635 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PTCH1Q13635 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTCH1Q13635 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PTCH1Q13635 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PTCH1Q13635 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PTCH1Q13635 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PTCH1Q13635 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
PTCH1Q13635 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTCH1Q13635 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
PTCH1Q13635 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PTCH1Q13635 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PTCH1Q13635 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PTCH1Q13635 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PTCH1Q13635 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PTCH1Q13635 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
PTCH1Q13635 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PTCH1Q13635 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PTCH1Q13635 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PTCH1Q13635 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PTCH1Q13635 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PTCH1Q13635 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PTCH1Q13635 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PTCH1Q13635 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PTCH1Q13635 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PTCH1Q13635 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
PTCH1Q13635 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTCH1Q13635 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PTCH1Q13635 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTCH1Q13635 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
PTCH1Q13635 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
PTCH1Q13635 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
PTCH1Q13635 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PTCH1Q13635 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PTCH1Q13635 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
PTCH1Q13635 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PTCH1Q13635 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PTCH1Q13635 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PTCH1Q13635 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PTCH1Q13635 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PTCH1Q13635 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PTCH1Q13635 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PTCH1Q13635 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
PTCH1Q13635 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PTCH1Q13635 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTCH1Q13635 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTCH1Q13635 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PTCH1Q13635 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PTCH1Q13635 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PTCH1Q13635 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PTCH1Q13635 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PTCH1Q13635 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTCH1Q13635 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PTCH1Q13635 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PTCH1Q13635 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTCH1Q13635 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTCH1Q13635 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTCH1Q13635 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTCH1Q13635 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTCH1Q13635 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTCH1Q13635 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PTCH1Q13635 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTCH1Q13635 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTCH1Q13635 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PTCH1Q13635 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PTCH1Q13635 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PTCH1Q13635 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
PTCH1Q13635 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PTCH1Q13635 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PTCH1Q13635 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PTCH1Q13635 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
PTCH1Q13635 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTCH1Q13635 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTCH1Q13635 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PTCH1Q13635 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTCH1Q13635 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PTCH1Q13635 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTCH1Q13635 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTCH1Q13635 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTCH1Q13635 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PTCH1Q13635 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PTCH1Q13635 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
PTCH1Q13635 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PTCH1Q13635 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
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