Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSTA3Q13630 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSTA3Q13630 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSTA3Q13630 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSTA3Q13630 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSTA3Q13630 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSTA3Q13630 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSTA3Q13630 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSTA3Q13630 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSTA3Q13630 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TSTA3Q13630 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSTA3Q13630 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TSTA3Q13630 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSTA3Q13630 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSTA3Q13630 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSTA3Q13630 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSTA3Q13630 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TSTA3Q13630 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSTA3Q13630 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSTA3Q13630 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSTA3Q13630 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSTA3Q13630 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSTA3Q13630 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSTA3Q13630 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSTA3Q13630 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSTA3Q13630 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSTA3Q13630 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TSTA3Q13630 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSTA3Q13630 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSTA3Q13630 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSTA3Q13630 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSTA3Q13630 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSTA3Q13630 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSTA3Q13630 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSTA3Q13630 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSTA3Q13630 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSTA3Q13630 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TSTA3Q13630 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSTA3Q13630 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSTA3Q13630 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSTA3Q13630 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSTA3Q13630 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSTA3Q13630 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSTA3Q13630 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSTA3Q13630 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSTA3Q13630 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSTA3Q13630 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSTA3Q13630 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSTA3Q13630 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSTA3Q13630 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSTA3Q13630 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSTA3Q13630 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSTA3Q13630 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSTA3Q13630 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSTA3Q13630 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSTA3Q13630 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSTA3Q13630 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSTA3Q13630 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSTA3Q13630 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSTA3Q13630 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSTA3Q13630 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms