Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CUL4BQ13620 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CUL4BQ13620 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CUL4BQ13620 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CUL4BQ13620 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CUL4BQ13620 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CUL4BQ13620 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CUL4BQ13620 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CUL4BQ13620 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CUL4BQ13620 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CUL4BQ13620 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CUL4BQ13620 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CUL4BQ13620 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CUL4BQ13620 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CUL4BQ13620 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CUL4BQ13620 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CUL4BQ13620 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CUL4BQ13620 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CUL4BQ13620 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CUL4BQ13620 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CUL4BQ13620 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CUL4BQ13620 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CUL4BQ13620 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CUL4BQ13620 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CUL4BQ13620 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CUL4BQ13620 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CUL4BQ13620 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CUL4BQ13620 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CUL4BQ13620 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CUL4BQ13620 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CUL4BQ13620 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CUL4BQ13620 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CUL4BQ13620 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CUL4BQ13620 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CUL4BQ13620 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CUL4BQ13620 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CUL4BQ13620 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CUL4BQ13620 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CUL4BQ13620 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CUL4BQ13620 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CUL4BQ13620 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CUL4BQ13620 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CUL4BQ13620 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CUL4BQ13620 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CUL4BQ13620 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CUL4BQ13620 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CUL4BQ13620 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CUL4BQ13620 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CUL4BQ13620 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CUL4BQ13620 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CUL4BQ13620 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CUL4BQ13620 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CUL4BQ13620 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CUL4BQ13620 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CUL4BQ13620 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CUL4BQ13620 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CUL4BQ13620 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CUL4BQ13620 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CUL4BQ13620 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CUL4BQ13620 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CUL4BQ13620 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CUL4BQ13620 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CUL4BQ13620 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CUL4BQ13620 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CUL4BQ13620 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CUL4BQ13620 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CUL4BQ13620 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CUL4BQ13620 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CUL4BQ13620 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CUL4BQ13620 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CUL4BQ13620 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CUL4BQ13620 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CUL4BQ13620 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CUL4BQ13620 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CUL4BQ13620 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CUL4BQ13620 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CUL4BQ13620 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CUL4BQ13620 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CUL4BQ13620 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CUL4BQ13620 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CUL4BQ13620 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CUL4BQ13620 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CUL4BQ13620 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CUL4BQ13620 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CUL4BQ13620 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
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