Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CUL4AQ13619 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CUL4AQ13619 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CUL4AQ13619 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CUL4AQ13619 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CUL4AQ13619 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CUL4AQ13619 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CUL4AQ13619 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CUL4AQ13619 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CUL4AQ13619 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CUL4AQ13619 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CUL4AQ13619 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CUL4AQ13619 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CUL4AQ13619 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CUL4AQ13619 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CUL4AQ13619 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CUL4AQ13619 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CUL4AQ13619 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CUL4AQ13619 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CUL4AQ13619 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CUL4AQ13619 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CUL4AQ13619 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CUL4AQ13619 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CUL4AQ13619 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CUL4AQ13619 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CUL4AQ13619 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CUL4AQ13619 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CUL4AQ13619 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CUL4AQ13619 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CUL4AQ13619 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CUL4AQ13619 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CUL4AQ13619 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CUL4AQ13619 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CUL4AQ13619 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CUL4AQ13619 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CUL4AQ13619 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CUL4AQ13619 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CUL4AQ13619 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CUL4AQ13619 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CUL4AQ13619 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CUL4AQ13619 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CUL4AQ13619 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CUL4AQ13619 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CUL4AQ13619 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CUL4AQ13619 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CUL4AQ13619 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CUL4AQ13619 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUL4AQ13619 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUL4AQ13619 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CUL4AQ13619 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CUL4AQ13619 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CUL4AQ13619 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUL4AQ13619 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUL4AQ13619 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CUL4AQ13619 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CUL4AQ13619 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CUL4AQ13619 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CUL4AQ13619 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CUL4AQ13619 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CUL4AQ13619 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CUL4AQ13619 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CUL4AQ13619 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CUL4AQ13619 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CUL4AQ13619 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CUL4AQ13619 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CUL4AQ13619 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUL4AQ13619 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUL4AQ13619 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUL4AQ13619 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUL4AQ13619 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUL4AQ13619 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUL4AQ13619 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUL4AQ13619 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CUL4AQ13619 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CUL4AQ13619 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CUL4AQ13619 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CUL4AQ13619 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CUL4AQ13619 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CUL4AQ13619 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CUL4AQ13619 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CUL4AQ13619 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CUL4AQ13619 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CUL4AQ13619 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CUL4AQ13619 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CUL4AQ13619 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CUL4AQ13619 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CUL4AQ13619 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CUL4AQ13619 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
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