Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUSP4Q13115 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DUSP4Q13115 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUSP4Q13115 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUSP4Q13115 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUSP4Q13115 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUSP4Q13115 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUSP4Q13115 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUSP4Q13115 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUSP4Q13115 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUSP4Q13115 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DUSP4Q13115 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DUSP4Q13115 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DUSP4Q13115 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DUSP4Q13115 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
DUSP4Q13115 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DUSP4Q13115 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DUSP4Q13115 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DUSP4Q13115 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DUSP4Q13115 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DUSP4Q13115 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUSP4Q13115 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUSP4Q13115 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUSP4Q13115 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUSP4Q13115 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUSP4Q13115 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUSP4Q13115 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DUSP4Q13115 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DUSP4Q13115 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DUSP4Q13115 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
DUSP4Q13115 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP4Q13115 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DUSP4Q13115 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUSP4Q13115 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUSP4Q13115 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUSP4Q13115 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUSP4Q13115 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUSP4Q13115 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUSP4Q13115 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUSP4Q13115 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUSP4Q13115 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUSP4Q13115 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DUSP4Q13115 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DUSP4Q13115 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DUSP4Q13115 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DUSP4Q13115 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DUSP4Q13115 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DUSP4Q13115 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DUSP4Q13115 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUSP4Q13115 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUSP4Q13115 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUSP4Q13115 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUSP4Q13115 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUSP4Q13115 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUSP4Q13115 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUSP4Q13115 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DUSP4Q13115 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DUSP4Q13115 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
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