Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMAN2Q12907 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMAN2Q12907 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LMAN2Q12907 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMAN2Q12907 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMAN2Q12907 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMAN2Q12907 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMAN2Q12907 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMAN2Q12907 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMAN2Q12907 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMAN2Q12907 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LMAN2Q12907 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMAN2Q12907 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMAN2Q12907 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMAN2Q12907 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LMAN2Q12907 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMAN2Q12907 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMAN2Q12907 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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