Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMAN2Q12907 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMAN2Q12907 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LMAN2Q12907 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMAN2Q12907 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMAN2Q12907 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMAN2Q12907 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMAN2Q12907 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMAN2Q12907 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMAN2Q12907 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMAN2Q12907 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMAN2Q12907 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMAN2Q12907 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LMAN2Q12907 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMAN2Q12907 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMAN2Q12907 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMAN2Q12907 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMAN2Q12907 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMAN2Q12907 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LMAN2Q12907 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMAN2Q12907 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMAN2Q12907 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMAN2Q12907 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LMAN2Q12907 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMAN2Q12907 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMAN2Q12907 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms