Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPQ12770 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPQ12770 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPQ12770 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPQ12770 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPQ12770 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPQ12770 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPQ12770 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPQ12770 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPQ12770 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAPQ12770 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAPQ12770 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPQ12770 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPQ12770 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPQ12770 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPQ12770 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPQ12770 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPQ12770 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPQ12770 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPQ12770 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPQ12770 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPQ12770 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPQ12770 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPQ12770 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPQ12770 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPQ12770 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPQ12770 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPQ12770 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPQ12770 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPQ12770 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCAPQ12770 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCAPQ12770 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPQ12770 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPQ12770 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCAPQ12770 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPQ12770 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPQ12770 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPQ12770 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPQ12770 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPQ12770 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPQ12770 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPQ12770 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPQ12770 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPQ12770 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPQ12770 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPQ12770 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SCAPQ12770 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPQ12770 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPQ12770 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPQ12770 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPQ12770 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPQ12770 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPQ12770 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPQ12770 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPQ12770 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SCAPQ12770 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPQ12770 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAPQ12770 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAPQ12770 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPQ12770 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPQ12770 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPQ12770 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPQ12770 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPQ12770 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPQ12770 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAPQ12770 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPQ12770 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPQ12770 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPQ12770 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPQ12770 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPQ12770 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPQ12770 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPQ12770 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPQ12770 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPQ12770 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPQ12770 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPQ12770 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPQ12770 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPQ12770 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPQ12770 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPQ12770 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPQ12770 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAPQ12770 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPQ12770 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPQ12770 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPQ12770 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPQ12770 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
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