Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCRN3Q0VDG4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCRN3Q0VDG4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCRN3Q0VDG4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCRN3Q0VDG4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCRN3Q0VDG4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCRN3Q0VDG4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCRN3Q0VDG4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCRN3Q0VDG4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCRN3Q0VDG4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCRN3Q0VDG4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCRN3Q0VDG4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCRN3Q0VDG4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCRN3Q0VDG4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCRN3Q0VDG4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCRN3Q0VDG4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCRN3Q0VDG4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCRN3Q0VDG4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCRN3Q0VDG4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCRN3Q0VDG4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCRN3Q0VDG4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCRN3Q0VDG4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCRN3Q0VDG4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCRN3Q0VDG4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCRN3Q0VDG4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCRN3Q0VDG4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCRN3Q0VDG4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCRN3Q0VDG4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCRN3Q0VDG4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCRN3Q0VDG4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCRN3Q0VDG4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCRN3Q0VDG4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCRN3Q0VDG4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCRN3Q0VDG4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCRN3Q0VDG4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCRN3Q0VDG4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCRN3Q0VDG4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCRN3Q0VDG4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCRN3Q0VDG4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCRN3Q0VDG4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCRN3Q0VDG4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCRN3Q0VDG4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms